RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDIA6Q15084 440 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 HLFQ16534 295 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRELPP51888 382 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNBD1Q8NA66 436 aa23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC3-202ENST00000373162 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTLL6Q8N841 843 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 H0YIN7 160 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLX4Q8IY92 1834 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF3CO14782 793 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDE6BP35913 854 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC184Q52MB2 194 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 SRGNP10124 158 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 CACNA1SQ13698 1873 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 NFKBIEO00221 500 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 NEUROD2Q15784 382 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 RASSF7Q02833 373 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 KRT24Q2M2I5 525 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 PROSER3Q2NL68 480 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 STYK1Q6J9G0 422 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABCC12Q96J65 1359 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF853P0CG23 659 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 ST5P78524 1137 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYL6BP14649 208 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNED1Q8TER0 1413 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 APAF1O14727 1248 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 MASTLQ96GX5 879 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 CFAP44Q96MT7 982 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNF181Q9P0P0 153 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXB7P09629 217 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 NGEFQ8N5V2 710 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANXA1P04083 346 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 CRY2Q49AN0 593 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 NTSR2O95665 410 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 LMNB1P20700 586 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNKSR1Q969H4 720 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-202ENST00000373162 C21orf2O43822 256 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 MBIPQ9NS73 344 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 NPR1P16066 1061 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 SUSD4Q5VX71 490 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 NYXQ9GZU5 481 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFT57Q9NWB7 429 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM177BA6PVY3 158 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPTP24298 496 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERFEQ4G0M1 354 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 NPHP1O15259 732 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 COPS6Q7L5N1 327 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 LAMB2P55268 1798 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 NECTIN2Q92692 538 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-202ENST00000373162 WDR90Q96KV7 1748 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSPA6P17066 643 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 PARP10Q53GL7 1025 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC27Q2M243 656 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 GNAI1P63096 354 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3-202ENST00000373162 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms