RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 TTC22Q5TAA0 569 aa22■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 LRRCC1Q9C099 1032 aa22■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.99■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 CACNA1FO60840 1977 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 PDE1AP54750 535 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 SSH3Q8TE77 659 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 GRM8O00222 908 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 LINS1Q8NG48 757 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 FAM182BQ5T319 152 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 C8orf37Q96NL8 207 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 RILPL2Q969X0 211 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 EXOC5O00471 708 aa21.95■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.95■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 KCNQ4P56696 695 aa21.94■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 ATG3Q9NT62 314 aa21.94■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 GCKRQ14397 625 aa21.94■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.93■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.93■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 POLA2Q14181 598 aa21.93■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 MX1P20591 662 aa21.93■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.93■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 TOM1O60784 492 aa21.92■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.92■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.92■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.92■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 A0A087WZG4 1122 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 PDE4CQ08493 712 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 CDC45O75419 566 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 SYNE4Q8N205 404 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 MRC1P22897 1456 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 ALDH1L1O75891 902 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 KCNQ2O43526 872 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 SMIM5Q71RC9 77 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 IL25Q9H293 177 aa21.89■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.89■■□□□ 1.1
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC6O95255 1503 aa21.89■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 TPM2P07951 284 aa21.89■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 NGLY1Q96IV0 654 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 DDB1Q16531 1140 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 GPTP24298 496 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 KIF2CQ99661 725 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 PANK2Q9BZ23 570 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 GLI3P10071 1580 aa21.86■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 PHLPP1O60346 1717 aa21.86■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.86■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.86■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 SASH1O94885 1247 aa21.85■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.85■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 HLFQ16534 295 aa21.84■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.84■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.84■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 FAM177BA6PVY3 158 aa21.83■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PDE4D-204ENST00000358923 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.83■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.83■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 AACSQ86V21 672 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 DISP2A7MBM2 1401 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 FAM89AQ96GI7 184 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 ESPNB1AK53 854 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 FSD2A1L4K1 749 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 MTX1Q13505 466 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 CHGBP05060 677 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE4D-204ENST00000358923 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms