RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VPS53Q5VIR6 699 aa26.9■■□□□ 1.9
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COG3Q96JB2 828 aa26.9■■□□□ 1.9
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.86■■□□□ 1.89
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF446Q9NWS9 450 aa26.84■■□□□ 1.89
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.84■■□□□ 1.89
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.82■■□□□ 1.88
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPG7Q9UQ90 795 aa26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.8■■□□□ 1.88
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DTNBO60941 627 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SKILP12757 684 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FERMT3Q86UX7 667 aa26.78■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NECAB1Q8N987 351 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CPS1P31327 1500 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITSN1Q15811 1721 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCZ1BP86790 482 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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