RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCT4P50991 539 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARXQ96QS3 562 aa30.11■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C1orf115Q9H7X2 142 aa30.11■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.11■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.11■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APBA3O96018 575 aa30.1■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MEIS3Q99687 375 aa30.1■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.09■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.09■■■□□ 2.41
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYD88Q99836 296 aa30.08■■■□□ 2.41
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP10DQ9P241 1426 aa30.07■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AMIGO3Q86WK7 504 aa30.06■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa30.05■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TXNRD1Q16881 649 aa30.05■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HLFQ16534 295 aa30.03■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP44Q9H0E7 712 aa30.03■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.03■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.02■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNPATO15228 680 aa30.01■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL15A1P39059 1388 aa30.01■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLSCR1O15162 318 aa30.01■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEURL1BA8MQ27 555 aa30■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGHDP01880 384 aa29.99■■■□□ 2.39
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.99■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.99■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALDH1L1O75891 902 aa29.98■■■□□ 2.39
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP98P52948 1817 aa29.97■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPS6KA4O75676 772 aa29.96■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHF14O94880 888 aa29.95■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAMTA2O94983 1202 aa29.95■■■□□ 2.39
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCIRG1Q13488 830 aa29.94■■■□□ 2.38
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.94■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPTP24298 496 aa29.93■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNAI3P08754 354 aa29.92■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.92■■■□□ 2.38
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.91■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNAI2P04899 355 aa29.9■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF827Q17R98 1081 aa29.9■■■□□ 2.38
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.89■■■□□ 2.38
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.87■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.87■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa29.87■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCN7AQ01118 1682 aa29.86■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KAZALD1Q96I82 304 aa29.86■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.86■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.85■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.85■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASP7P55210 303 aa29.84■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.84■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NLRP10Q86W26 655 aa29.84■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SKAP1Q86WV1 359 aa29.84■■■□□ 2.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.84■■■□□ 2.37
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