RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176506.7

Meis3-205, Transcript of Homeobox protein Meis3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Meis3, Length 1,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3-205ENSMUST00000176506 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Brpf1B2RRD7 1212 aa23.11■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Taf5lQ91WQ5 589 aa23.11■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Syde2E9PUP1 1314 aa23.11■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Fam228bQ497Q6 232 aa23.1■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 AbraQ8BUZ1 375 aa23.1■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ehd4Q9EQP2 541 aa23.1■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Mst1rQ62190 1378 aa23.09■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Cyb5rlB1AS42 316 aa23.09■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Mrc1Q61830 1456 aa23.09■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Soga3Q6NZL0 945 aa23.08■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ginm1Q91WR6 327 aa23.08■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 Shank3Q4ACU6 1730 aa23.08■■□□□ 1.29
Meis3-205ENSMUST00000176506 CalcaP70160 136 aa23.07■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Smim5Q8BT42 78 aa23.07■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Brf1Q8CFK2 676 aa23.07■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Rhot2Q8JZN7 620 aa23.07■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Stard3nlQ9DCI3 235 aa23.07■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Rad50P70388 1312 aa23.07■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 GpkowQ56A08 488 aa23.06■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa23.06■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Lrp6O88572 1613 aa23.06■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 AK157302I3ITR1 129 aa23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Gm12185Q5NCB2 835 aa23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Isca1Q9D924 129 aa23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ms4a2P20490 235 aa23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Atp6v1dP57746 247 aa23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Cwc25Q9DBF7 416 aa23.05■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Akap11E9Q777 1895 aa23.04■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa23.04■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ric1Q69ZJ7 1422 aa23.03■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 NmiO35309 314 aa23.03■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Hspa2P17156 633 aa23.03■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Smc4Q8CG47 1286 aa23.03■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 ApobrQ8VBT6 942 aa23.03■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa23.02■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Adora1Q60612 326 aa23.02■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Slc26a8Q8R0C3 999 aa23.02■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Sos2Q02384 1333 aa23.02■■□□□ 1.28
Meis3-205ENSMUST00000176506 Vwa3bJ9JI28 736 aa23.01■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Sik1Q60670 779 aa23.01■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ank1Q02357 1862 aa23.01■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ddit3P35639 168 aa23.01■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ccdc7Q9D541 371 aa23.01■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 AtrnQ9WU60 1428 aa23■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Nav1Q8CH77 1875 aa23■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa23■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Pde4dQ01063 747 aa23■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Top1mtQ8R4U6 593 aa23■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Stk3Q9JI10 497 aa23■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa23■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Col22a1E9Q7P1 1613 aa23■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ddx11Q6AXC6 880 aa22.99■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 NexnQ7TPW1 607 aa22.99■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Q8C5K5 320 aa22.99■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Fam213aQ9CYH2 218 aa22.99■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Prl3d2F6R3P9 224 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Znf526Q8BI66 675 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Jakmip1Q8BVL9 626 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 KinQ8K339 391 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Cap2Q9CYT6 476 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Myd88P22366 296 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ets1P27577 440 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Strn4P58404 760 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ssh1Q76I79 1042 aa22.98■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa22.97■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Col4a1P02463 1669 aa22.97■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa22.97■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Filip1lQ6P6L0 1131 aa22.96■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Exoc5Q3TPX4 708 aa22.96■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Meis3-205ENSMUST00000176506 Vps33bP59016 617 aa22.95■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Jmjd4Q8BFT6 427 aa22.95■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Add2Q9QYB8 725 aa22.95■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 EspnlQ3UYR4 1005 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 MetP16056 1379 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Kat6bQ8BRB7 1872 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Sult6b1P0CC03 303 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Mctp2Q5RJH2 878 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 NfkbibQ60778 359 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Pm20d1Q8C165 503 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa22.94■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 Dcaf5Q80T85 946 aa22.93■■□□□ 1.26
Meis3-205ENSMUST00000176506 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 75 ms