RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Shank2Q80Z38 1476 aa28.51■■■□□ 2.15
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mum1Q6DID5 682 aa28.49■■■□□ 2.15
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ddx58Q6Q899 926 aa28.49■■■□□ 2.15
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa28.49■■■□□ 2.15
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Dhx38Q80X98 1228 aa28.47■■■□□ 2.15
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Cntnap1O54991 1385 aa28.4■■■□□ 2.14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ubap1lG3UW59 384 aa28.4■■■□□ 2.14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Strn4P58404 760 aa28.4■■■□□ 2.14
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Unc5clQ6R653 518 aa28.38■■■□□ 2.13
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Bicdl1A0JNT9 577 aa28.37■■■□□ 2.13
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam228bQ497Q6 232 aa28.37■■■□□ 2.13
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa28.35■■■□□ 2.13
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Suds3-201ENSMUST00000086471 GptQ8QZR5 496 aa28.34■■■□□ 2.13
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q8C5K5 320 aa28.33■■■□□ 2.13
Suds3-201ENSMUST00000086471 Neurod6P48986 337 aa28.33■■■□□ 2.13
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Mrc1Q61830 1456 aa28.31■■■□□ 2.12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam213aQ9CYH2 218 aa28.31■■■□□ 2.12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vps33bP59016 617 aa28.3■■■□□ 2.12
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp19a1P28649 503 aa28.29■■■□□ 2.12
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm10093D3YYI8 482 aa28.28■■■□□ 2.12
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa28.27■■■□□ 2.12
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem87bQ8BKU8 555 aa28.27■■■□□ 2.12
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Cypt2Q6P924 180 aa28.26■■■□□ 2.11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa28.26■■■□□ 2.11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sult6b1P0CC03 303 aa28.24■■■□□ 2.11
Suds3-201ENSMUST00000086471 DbnlQ62418 436 aa28.24■■■□□ 2.11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trip6Q9Z1Y4 480 aa28.24■■■□□ 2.11
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