RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Palm3A2TJV2 734 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc4a4O88343 1079 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp42P22227 288 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tspyl2Q7TQI8 677 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cfap58B2RW38 873 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gjb2Q00977 226 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spocd1B1ASB6 936 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cfap53Q9D439 514 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem87bQ8BKU8 555 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DlatQ8BMF4 642 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arap1Q4LDD4 1452 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MthfsQ9D110 203 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cfap65Q3V0B4 1847 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abtb2Q7TQI7 1024 aa20.21■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Miga2Q8BK03 593 aa20.21■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim11Q99PQ2 467 aa20.21■□□□□ 0.83
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abcc5Q9R1X5 1436 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fbxo2Q80UW2 297 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pram1Q6BCL1 675 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tax1bp1Q3UKC1 814 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc181Q80ZU5 509 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eid1Q9DCR4 169 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sptbn5F6UCX4 1208 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp2b3Q0VF55 1220 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TxlnbQ8VBT1 685 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttc12Q8BW49 704 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CpvlQ9D3S9 478 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sil1Q9EPK6 465 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vps16Q920Q4 839 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Grin2aP35436 1464 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CenpqQ9CPQ5 267 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep120Q7TSG1 988 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 DymQ8CHY3 669 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif6O55135 245 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gbp4Q61107 620 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Phldb2Q8K1N2 1249 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Api5O35841 504 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sos1Q62245 1319 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kmt5bQ3U8K7 883 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Metap2O08663 478 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AI481877A2ALV5 1481 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Svs3aF2Z472 265 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fchsd1Q6PFY1 688 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NppbP40753 121 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dbndd1Q9CZ00 160 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TchpQ3TVW5 497 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dydc1Q9D9T0 175 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Elf1Q60775 612 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prkag2Q91WG5 566 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kank1E9Q238 1360 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdkn1cP49919 348 aa20.14■□□□□ 0.82
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm4758L7N258 96 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tacc1Q6Y685 774 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bin1O08539 588 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ercc3P49135 783 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dok7Q18PE0 504 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GckrQ91X44 587 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sdc2P43407 202 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map3k12Q60700 888 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 WtapQ9ER69 396 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp2b4Q6Q477 1205 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tspyl3Q3UYP3 334 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Camsap2Q8C1B1 1461 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 1700018F24RikB2RW27 314 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dennd3A2RT67 1274 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HellsQ60848 821 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NinlQ6ZQ12 1394 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tshz3Q8CGV9 1081 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.1 ms