RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCL11P51671 97 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GEMP55040 296 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL10A1Q03692 680 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q0VFX4 171 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL24Q13007 206 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPM6BQ13491 265 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNX1Q13596 522 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFATC4Q14934 902 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XKR3Q5GH77 459 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCAF10Q5QP82 559 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NKAIN2Q5VXU1 208 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCSK4Q6UW60 755 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VASH2Q86V25 355 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CERS5Q8N5B7 392 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF114Q8NC26 417 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMED6Q8WW62 240 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 METTL21AQ8WXB1 218 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GLYATL1Q969I3 302 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MARK4Q96L34 752 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR137Q96N19 417 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NACA2Q9H009 215 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHST11Q9NPF2 352 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RIPK3Q9Y572 518 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 R4GN57 208 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAF1P21675 1872 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0U1RQV5 110 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MATN3O15232 486 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAPK13O15264 365 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF5CO60282 957 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLN5O75503 358 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOM1L1O75674 476 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUDT3O95989 172 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ODC1P11926 461 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDH1P12830 882 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEACAM1P13688 526 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBLP22087 321 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CA4P22748 312 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITGA3P26006 1051 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALDH4A1P30038 563 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP2R1AP30153 589 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEA11P43364 429 aa4.5□□□□□ -1.69
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 INHBCP55103 352 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYBPC1Q00872 1141 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FHL2Q14192 279 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HERC3Q15034 1050 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPHARQ15513 63 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HLFQ16534 295 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR33Q49SQ1 333 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPAT3Q53EU6 434 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 C5orf24Q7Z6I8 188 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM133AQ8N9E0 248 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF149Q8NC42 400 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR52N5Q8NH56 324 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSD17B8Q92506 261 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NSL1Q96IY1 281 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BTBD9Q96Q07 612 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FICDQ9BVA6 458 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAT2Q9GZY6 243 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MARCH7Q9H992 704 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FGF21Q9NSA1 209 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POT1Q9NUX5 634 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNT16Q9UBV4 365 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHRNA9Q9UGM1 479 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTNNA3Q9UI47 895 aa4.5□□□□□ -1.69
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