RNA–Protein interactions for RNA: YPR172W

YPR172W, Transcript of Putative pyridoxal 5'-phosphate synthase, yeast

Gene YPR172W, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR172W	YPR172W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.11	□□□□□ -1.59	not detected
YPR172W	YPR172W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	ACE2	P21192	770 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	CDC20	P26309	610 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	GEM1	P39722	662 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	RRT14	P40470	206 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	TMA10	Q06177	86 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	CDC6	P09119	513 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	INO1	P11986	533 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	SLA2	P33338	968 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	GCV2	P49095	1034 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	TYW3	P53177	273 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	EEB1	Q02891	456 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	MSC2	Q03455	724 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	YAP6	Q03935	383 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	RKM4	Q12504	494 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YPR172W	YPR172W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	PNT1	P38969	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	YPL066W	Q12194	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	EMC1	P25574	760 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	LST4	P34239	828 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	YKL107W	P34251	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	HFM1	P51979	1187 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	YGL176C	P46945	554 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	VPS62	P53285	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	SPO20	Q04359	397 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	HMI1	Q12039	706 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	ENA1	P13587	1091 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	CLN2	P20438	545 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	STE11	P23561	717 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	HCM1	P25364	564 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	MND2	P40577	368 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	SVF1	Q05515	481 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	XYL2	Q07993	356 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	TRM2	P33753	639 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	ZRG8	P40021	1076 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	YGR053C	P53234	283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	ESC2	Q06340	456 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	YLL058W	Q12198	575 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YPR172W	YPR172W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	TPO1	Q07824	586 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	OSW2	Q12202	724 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	PNS1	Q12412	539 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
YPR172W	YPR172W	POA1	P38218	177 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	MTC3	P53077	123 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	YAP1801	P38856	637 aa		5	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	GDE1	Q02979	1223 aa		5	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	PLB1	P39105	664 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	MSE1	P48525	536 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	PHO23	P50947	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	ADY3	Q07732	790 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	MDM38	Q08179	573 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	PUS9	Q12069	462 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	NTO1	Q12311	748 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	SRP101	P32916	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	YKL151C	P36059	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	MET12	P46151	657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	YGR012W	P53206	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	AGP1	P25376	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	MAD1	P40957	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	SUN4	P53616	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	SRT1	Q03175	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	PIN2	Q12057	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YPR172W	YPR172W	HIS5	P07172	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	FUN30	P31380	1131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	GIC1	P38785	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	AIM21	P40563	679 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	CWC24	P53769	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	VPS16	Q03308	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	CDA1	Q06702	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	SPE1	P08432	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	CCC2	P38995	1004 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	MBP1	P39678	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	RPC82	P32349	654 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	DCG1	P32460	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	IOC3	P43596	787 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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