RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	RPC31	P17890	251 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	SCT1	P32784	759 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	TIM23	P32897	222 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	PEX5	P35056	612 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	RRN3	P36070	627 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	HXT5	P38695	592 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	RRM3	P38766	723 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	IES5	P40060	125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	SPR28	Q04921	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	FRT1	Q99332	602 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KTR2	YKR061W	ADR1	P07248	1323 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MCM2	P29469	868 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	COQ2	P32378	372 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	CDC11	P32458	415 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	HIR1	P32479	840 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PTH2	P34222	208 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	BOL3	P39724	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TIM54	P47045	478 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	GPI8	P49018	411 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	UBX4	P54730	416 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	CTF4	Q01454	927 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RCF1	Q03713	159 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
KTR2	YKR061W	YLR352W	Q06479	807 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	REC8	Q12188	680 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RSF2	P46974	1380 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MPH2	P0CD99	609 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RSC6	P25632	483 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	ANP1	P32629	500 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YKL222C	P35995	705 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	KAE1	P36132	386 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	NIT1	P40447	199 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	DOT5	P40553	215 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TAF1	P46677	1066 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	SAM37	P50110	327 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	CWH41	P53008	833 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	SND1	Q04007	877 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PHM6	Q05637	104 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PUN1	Q06991	263 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MED7	Q08278	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	QCR6	P00127	147 aa		5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	VAN1	P23642	535 aa		5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TMA17	Q12513	150 aa		5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YIL177C	P40434	1758 aa		5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YJL225C	P40889	1758 aa		5	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MSM1	P22438	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YKL050C	P35736	922 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	APE4	P38821	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	BFA1	P47113	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RSC2	Q06488	889 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PSR2	Q07949	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MHP1	P43638	1398 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	MSH2	P25847	964 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PEX6	P33760	1030 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TAT2	P38967	592 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PES4	P39684	611 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PEA2	P40091	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	QDR2	P40474	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	XKS1	P42826	600 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	PMT3	P47190	753 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	HLJ1	P48353	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YGR237C	P50089	785 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	YNR040W	P53736	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	TAP42	Q04372	366 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KTR2	YKR061W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 85 ms