RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 GYS1P13807 737 aa29.47■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 RUNDC1Q96C34 613 aa29.46■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.46■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 ANP32CO43423 234 aa29.45■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.45■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.45■■■□□ 2.31
SYT6-210ENST00000641643 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.44■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 UTRNP46939 3433 aa29.43■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.43■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 COL15A1P39059 1388 aa29.43■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 NEUROD2Q15784 382 aa29.42■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 C4AP0C0L4 1744 aa29.4■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 A0A087WZG4 1122 aa29.4■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 PARP3Q9Y6F1 533 aa29.4■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 GPR162Q16538 588 aa29.39■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.39■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 NARFQ9UHQ1 456 aa29.39■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 USP16Q9Y5T5 823 aa29.39■■■□□ 2.3
SYT6-210ENST00000641643 FKBP8Q14318 412 aa29.39■■■□□ 2.29
SYT6-210ENST00000641643 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
SYT6-210ENST00000641643 A1BGP04217 495 aa29.38■■■□□ 2.29
SYT6-210ENST00000641643 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SYT6-210ENST00000641643 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
SYT6-210ENST00000641643 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.36■■■□□ 2.29
SYT6-210ENST00000641643 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.35■■■□□ 2.29
SYT6-210ENST00000641643 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.31■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 CCDC184Q52MB2 194 aa29.3■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.3■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 TM4SF1P30408 202 aa29.29■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 MRS2Q9HD23 443 aa29.29■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.29■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 DDR1Q08345 913 aa29.28■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.28■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 APAF1O14727 1248 aa29.27■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.27■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 YY1P25490 414 aa29.26■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 TGFB2P61812 414 aa29.26■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 NFIXQ14938 502 aa29.26■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
SYT6-210ENST00000641643 GRIN3BO60391 1043 aa29.25■■■□□ 2.27
SYT6-210ENST00000641643 C10orf71Q711Q0 1435 aa29.25■■■□□ 2.27
SYT6-210ENST00000641643 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.24■■■□□ 2.27
SYT6-210ENST00000641643 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.27
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SYT6-210ENST00000641643 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
SYT6-210ENST00000641643 NBPF15Q8N660 670 aa29.22■■■□□ 2.27
SYT6-210ENST00000641643 WWC3Q9ULE0 1092 aa29.22■■■□□ 2.27
SYT6-210ENST00000641643 CAMTA2O94983 1202 aa29.22■■■□□ 2.27
SYT6-210ENST00000641643 CHL1O00533 1208 aa29.2■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 SERPINB2P05120 415 aa29.2■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.2■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 A0A0G2JLW4 131 aa29.19■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.19■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 NGEFQ8N5V2 710 aa29.18■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 CFAP44Q96MT7 982 aa29.18■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 SETDB2Q96T68 719 aa29.18■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 LAMB4A4D0S4 1761 aa29.17■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 PXDNLA1KZ92 1463 aa29.17■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 KIF13BQ9NQT8 1826 aa29.17■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 DPEP1P16444 411 aa29.17■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
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SYT6-210ENST00000641643 MYL6BP14649 208 aa29.16■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 ERBB4Q15303 1308 aa29.15■■■□□ 2.26
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SYT6-210ENST00000641643 NPHP1O15259 732 aa29.14■■■□□ 2.26
SYT6-210ENST00000641643 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.14■■■□□ 2.26
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SYT6-210ENST00000641643 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.12■■■□□ 2.25
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SYT6-210ENST00000641643 GNAI1P63096 354 aa29.11■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 IFT57Q9NWB7 429 aa29.11■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 PIM2Q9P1W9 311 aa29.11■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 CHD4Q14839 1912 aa29.11■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 MBIPQ9NS73 344 aa29.09■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 CHRNA5P30532 468 aa29.09■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 NECTIN2Q92692 538 aa29.09■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 BCORQ6W2J9 1755 aa29.08■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 KRT24Q2M2I5 525 aa29.08■■■□□ 2.25
SYT6-210ENST00000641643 CNBD1Q8NA66 436 aa29.08■■■□□ 2.25
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