RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		28	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PIM2	Q9P1W9	311 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NARF	Q9UHQ1	456 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KIF3C	O14782	793 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CHRNA5	P30532	468 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TEF	Q10587	303 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NFIX	Q14938	502 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ZNF790	Q6PG37	636 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	STARD3NL	O95772	234 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	HSPA6	P17066	643 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CFAP53	Q96M91	514 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SCN7A	Q01118	1682 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PRKAR2B	P31323	418 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SBF1	O95248	1867 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SERPINB2	P05120	415 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074		A0A087WZG4	1122 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NUDC	Q9Y266	331 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KCNQ3	O43525	872 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TOMM70	O94826	608 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	A1BG	P04217	495 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RASSF7	Q02833	373 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TRAPPC3-208	ENST00000616074	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	MCM10	Q7L590	875 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TTLL6	Q8N841	843 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074		H0YIN7	160 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	USP16	Q9Y5T5	823 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PRELP	P51888	382 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAPPC3-208	ENST00000616074	APLP1	P51693	650 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	LMNB1	P20700	586 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	RRAGC	Q9HB90	399 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PDE6B	P35913	854 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CACNA1S	Q13698	1873 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	WDR90	Q96KV7	1748 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NFKBIE	O00221	500 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TRAPPC3-208	ENST00000616074	NPHP1	O15259	732 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TRAPPC3-208	ENST00000616074	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TRAPPC3-208	ENST00000616074	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TRAPPC3-208	ENST00000616074	C21orf2	O43822	256 aa		27.62	■■■□□ 2.01

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