RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC39A6Q13433 755 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC125Q86Z20 511 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 GNAI3P08754 354 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-212ENST00000591041 G2E3Q7L622 706 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 PAPPAQ13219 1627 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 HMMRO75330 724 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 KSR2Q6VAB6 950 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-212ENST00000591041 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 STARD3NLO95772 234 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 GCC1Q96CN9 775 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL9O00512 1426 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP10DQ9P241 1426 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0G2JS52 829 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 ALDH1L1O75891 902 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 GNAI2P04899 355 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 MYT1Q01538 1121 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 F6X3S4 739 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHDP01880 384 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 PIGBQ92521 554 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 C5P01031 1676 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-212ENST00000591041 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 USP16Q9Y5T5 823 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGB4P16144 1822 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 MYL6BP14649 208 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 ATG3Q9NT62 314 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 LINS1Q8NG48 757 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 PDIA6Q15084 440 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 SMC5Q8IY18 1101 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 MEIS3Q99687 375 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-212ENST00000591041 BEND3Q5T5X7 828 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 COPS6Q7L5N1 327 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCY9O60503 1353 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 GLI3P10071 1580 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 ANXA1P04083 346 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 PROSER3Q2NL68 480 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP85Q6P2H3 762 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-212ENST00000591041 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 USP44Q9H0E7 712 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS3P49796 1198 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 NUCB1Q02818 461 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 DCTPP1Q9H773 170 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP8B2P98198 1209 aa28.16■■■□□ 2.1
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