RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, human

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOMM40-205	ENST00000589649	MCM10	Q7L590	875 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TOMM40-205	ENST00000589649	COL15A1	P39059	1388 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TOMM40-205	ENST00000589649	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TOMM40-205	ENST00000589649	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TOMM40-205	ENST00000589649	TM4SF1	P30408	202 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TOMM40-205	ENST00000589649	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TOMM40-205	ENST00000589649	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TOMM40-205	ENST00000589649	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	STARD3NL	O95772	234 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	BCS1L	Q9Y276	419 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	KCNA3	P22001	575 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	NFIX	Q14938	502 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
TOMM40-205	ENST00000589649	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	A1BG	P04217	495 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	CHRNA5	P30532	468 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	ADCY9	O60503	1353 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
TOMM40-205	ENST00000589649		A0A087WZG4	1122 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	SERPINB2	P05120	415 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	NEFM	P07197	916 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TOMM40-205	ENST00000589649	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	RALBP1	Q15311	655 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
TOMM40-205	ENST00000589649	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	SCN7A	Q01118	1682 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TOMM40-205	ENST00000589649	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649		H0YIN7	160 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	RIPK4	P57078	832 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	TTLL6	Q8N841	843 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	KIF3C	O14782	793 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	RASSF7	Q02833	373 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	RNF181	Q9P0P0	153 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TOMM40-205	ENST00000589649	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	NPHP1	O15259	732 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	PDE6B	P35913	854 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	HLF	Q16534	295 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TOMM40-205	ENST00000589649	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		32.34	■■■□□ 2.77

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