RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 MRC1P22897 1456 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 TJP1Q07157 1748 aa8.94□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS6KA4O75676 772 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 MSL1Q68DK7 614 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 MTFR1LQ9H019 292 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 USP16Q9Y5T5 823 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.93□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 STARD3NLO95772 234 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 A1BGP04217 495 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 RFC4P35249 363 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.92□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 SSFA2P28290 1259 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 PTGER2P43116 358 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 ARXQ96QS3 562 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 POLD1P28340 1107 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-211ENST00000588374 LRP5O75197 1615 aa8.9□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 MIER1Q8N108 512 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 KLHL34Q8N239 644 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 CHL1O00533 1208 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 ZPR1O75312 459 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 NGEFQ8N5V2 710 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 GYS1P13807 737 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 NECTIN2Q92692 538 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP44Q96MT7 982 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 C4AP0C0L4 1744 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WZG4 1122 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF26B4DH59 902 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 CCER2I3L3R5 266 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 MYL6BP14649 208 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 GNAI1P63096 354 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP8Q14318 412 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT24Q2M2I5 525 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 WWC1Q8IX03 1113 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF15Q8N660 670 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 SYT17Q9BSW7 474 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 MBIPQ9NS73 344 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 NARFQ9UHQ1 456 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 COL15A1P39059 1388 aa8.86□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 MMP10P09238 476 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF853P0CG23 659 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC27Q2M243 656 aa8.85□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 TM4SF1P30408 202 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT57Q9NWB7 429 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.84□□□□□ -0.99
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.84□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 ANXA1P04083 346 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR63Q8IWG1 891 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.83□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMTA2O94983 1202 aa8.82□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
EFTUD2-211ENST00000588374 NFIXQ14938 502 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms