RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C5P01031 1676 aa20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALDH1L1O75891 902 aa20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANXA1P04083 346 aa20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KSR2Q6VAB6 950 aa20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTX1Q13505 466 aa20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HYPKQ9NX55 129 aa20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PROSER3Q2NL68 480 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MEGF6O75095 1541 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRC1P22897 1456 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST18O60284 1047 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHMLP26374 656 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GBP4Q96PP9 640 aa20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAK2O60296 914 aa20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPG7Q9UQ90 795 aa20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHKG2P15735 406 aa20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF790Q6PG37 636 aa20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RILPL2Q969X0 211 aa20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPDO75976 1380 aa20.17■□□□□ 0.82
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTMSP20962 102 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDIA6Q15084 440 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL17RAQ96F46 866 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UTYO14607 1347 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANAPC15P60006 121 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.16■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINS1Q8NG48 757 aa20.16■□□□□ 0.82
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.13■□□□□ 0.81
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.12■□□□□ 0.81
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC39A6Q13433 755 aa20.12■□□□□ 0.81
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCAF5Q96JK2 942 aa20.12■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRM8O00222 908 aa20.11■□□□□ 0.81
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MCM2P49736 904 aa20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FSD2A1L4K1 749 aa20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL27Q8NEV9 243 aa20.11■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CNTROBQ8N137 903 aa20.1■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP27B1O15528 508 aa20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHRNA2Q15822 529 aa20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLI3P10071 1580 aa20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KAZALD1Q96I82 304 aa20.09■□□□□ 0.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PALD1Q9ULE6 856 aa20.09■□□□□ 0.81
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