RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 ADCY9O60503 1353 aa34.09■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP34.08■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF790Q6PG37 636 aa34.08■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 COL15A1P39059 1388 aa34.08■■■■□ 3.05
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 NARFQ9UHQ1 456 aa34.07■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 CANXP27824 592 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa34.06■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 KCNA3P22001 575 aa34.05■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
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SPNS1-209ENST00000567771 STARD3NLO95772 234 aa34.03■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 FCHSD2O94868 740 aa34.02■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 BCL2L12Q9HB09 334 aa34.02■■■■□ 3.04
SPNS1-209ENST00000567771 NFIXQ14938 502 aa34■■■■□ 3.03
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
SPNS1-209ENST00000567771 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
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SPNS1-209ENST00000567771 KCNQ3O43525 872 aa33.99■■■■□ 3.03
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SPNS1-209ENST00000567771 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
SPNS1-209ENST00000567771 PIM2Q9P1W9 311 aa33.98■■■■□ 3.03
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SPNS1-209ENST00000567771 CHRNA5P30532 468 aa33.96■■■■□ 3.03
SPNS1-209ENST00000567771 MCM10Q7L590 875 aa33.96■■■■□ 3.03
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SPNS1-209ENST00000567771 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
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SPNS1-209ENST00000567771 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa33.89■■■■□ 3.02
SPNS1-209ENST00000567771 NRXN2Q9P2S2 1712 aa33.89■■■■□ 3.02
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SPNS1-209ENST00000567771 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa33.88■■■■□ 3.01
SPNS1-209ENST00000567771 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa33.86■■■■□ 3.01
SPNS1-209ENST00000567771 TBC1D9BQ66K14 1250 aa33.86■■■■□ 3.01
SPNS1-209ENST00000567771 CARMIL3Q8ND23 1372 aa33.83■■■■□ 3.01
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SPNS1-209ENST00000567771 ST5P78524 1137 aa33.62■■■□□ 2.97
SPNS1-209ENST00000567771 TOMM70O94826 608 aa33.61■■■□□ 2.97
SPNS1-209ENST00000567771 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
SPNS1-209ENST00000567771 NFKBIEO00221 500 aa33.6■■■□□ 2.97
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