RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 GPATCH3Q96I76 525 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 HYPKQ9NX55 129 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 TTC41PQ6P2S7 1318 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 CHMLP26374 656 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 CNTROBQ8N137 903 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 LGR6Q9HBX8 967 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.52e-10■■■□□ 15.7
CS-205ENST00000546891 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 SRGAP3O43295 1099 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 SURF6O75683 361 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 ERBB3P21860 1342 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 PXDNQ92626 1479 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 KSR2Q6VAB6 950 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 RILPL2Q969X0 211 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 ORAI2Q96SN7 254 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 SPG7Q9UQ90 795 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 ALS2Q96Q42 1657 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 ADCY9O60503 1353 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-205ENST00000546891 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 ADRA2BP18089 450 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 ATF3P18847 181 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 SSFA2P28290 1259 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 RUFY2Q8WXA3 655 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 ANO2Q9NQ90 1003 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 UTYO14607 1347 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 CUL4AQ13619 759 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 LINS1Q8NG48 757 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 HIP1O00291 1037 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 NEK4P51957 841 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 CERKQ8TCT0 537 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 FBXO41Q8TF61 875 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 MRC1P22897 1456 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 RAD50Q92878 1312 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 KCNQ3O43525 872 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 HSPA4P34932 840 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 GRM8O00222 908 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 SGSM2O43147 1006 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 TMX3Q96JJ7 454 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 CPDO75976 1380 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 COL15A1P39059 1388 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 MBD3O95983 291 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 PHKG2P15735 406 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 ZNF790Q6PG37 636 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-205ENST00000546891 ERBB4Q15303 1308 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms