RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 DCTN1Q14203 1278 aa31.88■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 BABAM1Q9NWV8 329 aa31.87■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 DLG5Q8TDM6 1919 aa31.86■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 TMPOP42166 694 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS8Q9UP79 889 aa31.85■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 GYS1P13807 737 aa31.84■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 SMIM5Q71RC9 77 aa31.84■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 COL15A1P39059 1388 aa31.83■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa31.83■■■□□ 2.69
PITX3-202ENST00000539804 MMP10P09238 476 aa31.82■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 PARP3Q9Y6F1 533 aa31.82■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 NARFQ9UHQ1 456 aa31.81■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 C4AP0C0L4 1744 aa31.79■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 KCNQ3O43525 872 aa31.78■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 EIF5P55010 431 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 CCDC146Q8IYE0 955 aa31.78■■■□□ 2.68
PITX3-202ENST00000539804 GPR162Q16538 588 aa31.75■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 USPL1Q5W0Q7 1092 aa31.74■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 TSPYL4Q9UJ04 414 aa31.74■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 NEUROD2Q15784 382 aa31.73■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 KDM3BQ7LBC6 1761 aa31.71■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 TGFB2P61812 414 aa31.71■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 FKBP8Q14318 412 aa31.71■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 MIS18AQ9NYP9 233 aa31.71■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 USP16Q9Y5T5 823 aa31.71■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 GRIN3BO60391 1043 aa31.7■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 A1BGP04217 495 aa31.7■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 NLGN2Q8NFZ4 835 aa31.7■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
PITX3-202ENST00000539804 RGL2O15211 777 aa31.69■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 MRS2Q9HD23 443 aa31.69■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 TM4SF1P30408 202 aa31.67■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 ZNF652Q9Y2D9 606 aa31.67■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 ERBB4Q15303 1308 aa31.66■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 LAMB4A4D0S4 1761 aa31.64■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 TRIM35Q9UPQ4 493 aa31.64■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 C10orf71Q711Q0 1435 aa31.64■■■□□ 2.66
PITX3-202ENST00000539804 APAF1O14727 1248 aa31.63■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 CLEC4GQ6UXB4 293 aa31.63■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa31.61■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 CHL1O00533 1208 aa31.61■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa31.61■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 KIF13BQ9NQT8 1826 aa31.61■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 NFIXQ14938 502 aa31.6■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 CFAP44Q96MT7 982 aa31.6■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 DDR1Q08345 913 aa31.59■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 SCN7AQ01118 1682 aa31.58■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 YY1P25490 414 aa31.58■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 SETDB2Q96T68 719 aa31.58■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 CHMP4AQ9BY43 222 aa31.58■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 BCL2L12Q9HB09 334 aa31.58■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
PITX3-202ENST00000539804 CAMTA2O94983 1202 aa31.57■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa31.57■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 CARMIL3Q8ND23 1372 aa31.56■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 SERPINB2P05120 415 aa31.56■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 HOXB7P09629 217 aa31.56■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 GNAI1P63096 354 aa31.56■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 IFT57Q9NWB7 429 aa31.55■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 NBPF26B4DH59 902 aa31.54■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 CCDC27Q2M243 656 aa31.54■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 KIF6Q6ZMV9 814 aa31.54■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 NBPF15Q8N660 670 aa31.54■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 NPHP1O15259 732 aa31.53■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 CCDC184Q52MB2 194 aa31.53■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 PXDNLA1KZ92 1463 aa31.52■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 ERVV-1B6SEH8 477 aa31.52■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D9BQ66K14 1250 aa31.52■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 BICDL1Q6ZP65 573 aa31.52■■■□□ 2.64
PITX3-202ENST00000539804 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 NGEFQ8N5V2 710 aa31.5■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 PIM2Q9P1W9 311 aa31.5■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 BCORQ6W2J9 1755 aa31.5■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 CHD4Q14839 1912 aa31.49■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 NRXN2Q9P2S2 1712 aa31.49■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 A0A0G2JLW4 131 aa31.48■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 DPEP1P16444 411 aa31.48■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 ST5P78524 1137 aa31.48■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 PDE6BP35913 854 aa31.47■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 ZNF853P0CG23 659 aa31.46■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 MYL6BP14649 208 aa31.46■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 CNBD1Q8NA66 436 aa31.46■■■□□ 2.63
PITX3-202ENST00000539804 BRIP1Q9BX63 1249 aa31.45■■■□□ 2.63
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