RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 USPL1Q5W0Q7 1092 aa32.33■■■□□ 2.77
ACER3-211ENST00000531461 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa32.32■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 NRXN2Q9P2S2 1712 aa32.31■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 GNAT3A8MTJ3 354 aa32.31■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa32.3■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 TTC5Q8N0Z6 440 aa32.29■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 IL17REQ8NFR9 667 aa32.29■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 KIF3CO14782 793 aa32.28■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 TEFQ10587 303 aa32.27■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
ACER3-211ENST00000531461 STARD3NLO95772 234 aa32.26■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 NFIXQ14938 502 aa32.26■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 ZNF790Q6PG37 636 aa32.26■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa32.26■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 CFAP53Q96M91 514 aa32.25■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 BCL2L12Q9HB09 334 aa32.25■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 HEG1Q9ULI3 1381 aa32.24■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 EIF5P55010 431 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 HSPA6P17066 643 aa32.23■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 CHRNA5P30532 468 aa32.22■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 RSPH6AQ9H0K4 717 aa32.22■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.22■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 SBF1O95248 1867 aa32.2■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 A0A087WZG4 1122 aa32.2■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 CANXP27824 592 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
ACER3-211ENST00000531461 PRKAR2BP31323 418 aa32.19■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 PHACTR3Q96KR7 559 aa32.19■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 NUDCQ9Y266 331 aa32.19■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 SERPINB2P05120 415 aa32.18■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 C9orf131Q5VYM1 1079 aa32.18■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 FMNL2Q96PY5 1086 aa32.17■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 SCN7AQ01118 1682 aa32.17■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 TOMM70O94826 608 aa32.15■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 PPP2R1AP30153 589 aa32.15■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
ACER3-211ENST00000531461 BTBD11A6QL63 1104 aa32.11■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 NMRK2Q9NPI5 230 aa32.1■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP32.09■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 RNF181Q9P0P0 153 aa32.09■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.08■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.08■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 CARMIL3Q8ND23 1372 aa32.07■■■□□ 2.73
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D9BQ66K14 1250 aa32.07■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 TTLL6Q8N841 843 aa32.07■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 KDM2BQ8NHM5 1336 aa32.06■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 H0YIN7 160 aa32.06■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 KCNQ3O43525 872 aa32.06■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa32.06■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 BCORQ6W2J9 1755 aa32.06■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 A1BGP04217 495 aa32.05■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 BICDL1Q6ZP65 573 aa32.05■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.05■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 CAMTA2O94983 1202 aa32.03■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.03■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 APLP1P51693 650 aa32.02■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
ACER3-211ENST00000531461 PDE6BP35913 854 aa32.01■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.01■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 USP16Q9Y5T5 823 aa32.01■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa32■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 LMNB1P20700 586 aa32■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 MCM10Q7L590 875 aa32■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 RASSF7Q02833 373 aa31.99■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 SETDB2Q96T68 719 aa31.99■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 CLEC4GQ6UXB4 293 aa31.97■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 RGL2O15211 777 aa31.96■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 DLG5Q8TDM6 1919 aa31.95■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 PRELPP51888 382 aa31.95■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 FSTL1Q12841 308 aa31.95■■■□□ 2.71
ACER3-211ENST00000531461 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa31.95■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa31.94■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 CNBD1Q8NA66 436 aa31.94■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 TIAM2Q8IVF5 1701 aa31.94■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 NFKBIEO00221 500 aa31.93■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 DCTN1Q14203 1278 aa31.93■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP31.92■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 RRAGCQ9HB90 399 aa31.92■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa31.91■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 GLTPD2A6NH11 291 aa31.91■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 ST5P78524 1137 aa31.91■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 WDR90Q96KV7 1748 aa31.91■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 LAMB4A4D0S4 1761 aa31.9■■■□□ 2.7
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