RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530002.1

USP2-AS1-203, Transcript of USP2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP2-AS1, Length 764 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2-AS1-203ENST00000530002 LTBP3Q9NS15 1303 aa13.68□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 EPHX2P34913 555 aa13.68□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 HACL1Q9UJ83 578 aa13.68□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.68□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 NRXN2Q9P2S2 1712 aa13.67□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 FKBP8Q14318 412 aa13.67□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.67□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 KDRP35968 1356 aa13.67□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.66□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa13.66□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 CIAPIN1Q6FI81 312 aa13.66□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.66□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 RPS6KA4O75676 772 aa13.65□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 TAOK3Q9H2K8 898 aa13.65□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 INSRP06213 1382 aa13.65□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
USP2-AS1-203ENST00000530002 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 BRCA2P51587 3418 aa13.64□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 CST9Q5W186 159 aa13.64□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 ASAP1Q9ULH1 1129 aa13.64□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 CYP27B1O15528 508 aa13.63□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 NME9Q86XW9 330 aa13.63□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 HHIPL1Q96JK4 782 aa13.63□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.63□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 TM4SF1P30408 202 aa13.62□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 SAPCD2Q86UD0 394 aa13.62□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 C2CD5Q86YS7 1000 aa13.62□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 TMOD3Q9NYL9 352 aa13.62□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 EVC2Q86UK5 1308 aa13.62□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 CENPFP49454 3210 aa13.62□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 C21orf2O43822 256 aa13.61□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP13.61□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 HTTP42858 3142 aa13.6□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 H0YIN7 160 aa13.6□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 HOXC9P31274 260 aa13.6□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 RNF123Q5XPI4 1314 aa13.6□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 NOGQ13253 232 aa13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 NBPF4Q96M43 638 aa13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 CEP290O15078 2479 aa13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 VCANP13611 3396 aa13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZNF541Q9H0D2 1346 aa13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 SCN11AQ9UI33 1791 aa13.58□□□□□ -0.23
USP2-AS1-203ENST00000530002 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.58□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.58□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 ATG3Q9NT62 314 aa13.58□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 AKAP11Q9UKA4 1901 aa13.57□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 SLC4A9Q96Q91 983 aa13.57□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa13.57□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 CACNA1SQ13698 1873 aa13.57□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 TRAF5O00463 557 aa13.56□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa13.56□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 RTL1A6NKG5 1358 aa13.56□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 AMPHP49418 695 aa13.55□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 CARMIL3Q8ND23 1372 aa13.55□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 BCORQ6W2J9 1755 aa13.54□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 SOGA3Q5TF21 947 aa13.54□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 LAMA3Q16787 3333 aa13.53□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZIC5Q96T25 663 aa13.53□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa13.53□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 SLX4Q8IY92 1834 aa13.53□□□□□ -0.24
USP2-AS1-203ENST00000530002 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 BICDL1Q6ZP65 573 aa13.52□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 GPC2Q8N158 579 aa13.52□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 NFIXQ14938 502 aa13.51□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 ZPR1O75312 459 aa13.5□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 TRPA1O75762 1119 aa13.5□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 SERPINB2P05120 415 aa13.5□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 CRKLP46109 303 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 USPL1Q5W0Q7 1092 aa13.5□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 RNF186Q9NXI6 227 aa13.5□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 MPNDQ8N594 471 aa13.49□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 TJP1Q07157 1748 aa13.48□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.48□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 FZD9O00144 591 aa13.47□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 PDE6BP35913 854 aa13.47□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
USP2-AS1-203ENST00000530002 OTUD5Q96G74 571 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.9 ms