RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 NEFMP07197 916 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 DCAF5Q96JK2 942 aa22.18■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 NFE2L2Q16236 605 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 SPG7Q9UQ90 795 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 NGEFQ8N5V2 710 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 RNF181Q9P0P0 153 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 APAF1O14727 1248 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 GYS1P13807 737 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.15■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PACS1-208ENST00000529677 ATP6V1AP38606 617 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 ATG3Q9NT62 314 aa22.13■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 CCDC27Q2M243 656 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.12■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 PHKG2P15735 406 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.11■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.1■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.09■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.08■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 RIPK4P57078 832 aa22.08■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 PIM2Q9P1W9 311 aa22.08■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.08■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PACS1-208ENST00000529677 MRC1P22897 1456 aa22.08■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 CHRNA5P30532 468 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 RASSF7Q02833 373 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 DDR1Q08345 913 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.07■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 ZNF521Q96K83 1311 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 POTECB2RU33 542 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.05■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.05■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 ADRA2BP18089 450 aa22.03■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 WWC1Q8IX03 1113 aa22.03■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 NEUROD2Q15784 382 aa22.02■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 IL17REQ8NFR9 667 aa22.02■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PACS1-208ENST00000529677 TJP1Q07157 1748 aa22.01■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 GLTPD2A6NH11 291 aa22.01■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 FOXN1O15353 648 aa22.01■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 RPS6KA4O75676 772 aa22.01■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 FKBP8Q14318 412 aa22.01■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 WDR63Q8IWG1 891 aa21.99■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 IL16Q14005 1332 aa21.99■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.98■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 RFC4P35249 363 aa21.98■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 MCM10Q7L590 875 aa21.98■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 LGR6Q9HBX8 967 aa21.98■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.97■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 DCTN1Q14203 1278 aa21.97■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.96■■□□□ 1.11
PACS1-208ENST00000529677 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 ZNF853P0CG23 659 aa21.94■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 LMNB1P20700 586 aa21.94■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.94■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.94■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 NFKBIEO00221 500 aa21.93■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 POTEIP0CG38 1075 aa21.93■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 POTEJP0CG39 1038 aa21.93■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 TM4SF1P30408 202 aa21.93■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.93■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 FAM161AQ3B820 660 aa21.92■■□□□ 1.1
PACS1-208ENST00000529677 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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