RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528395.1

TMX2-CTNND1-201, Transcript of TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMX2-CTNND1, Length 585 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 SMIM5Q71RC9 77 aa14.75□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.75□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 APAF1O14727 1248 aa14.74□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.74□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.74□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.73□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 A0A087WZG4 1122 aa14.72□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 MSL1Q68DK7 614 aa14.72□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.72□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 USP16Q9Y5T5 823 aa14.72□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CHL1O00533 1208 aa14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 GYS1P13807 737 aa14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 SYT17Q9BSW7 474 aa14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NARFQ9UHQ1 456 aa14.71□□□□□ -0.05
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 COL15A1P39059 1388 aa14.71□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 ZPR1O75312 459 aa14.7□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 A1BGP04217 495 aa14.7□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CCDC27Q2M243 656 aa14.69□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CFAP44Q96MT7 982 aa14.69□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.68□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.68□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 C4AP0C0L4 1744 aa14.68□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 MMP10P09238 476 aa14.67□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CCER2I3L3R5 266 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 ZNF853P0CG23 659 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 GNAI1P63096 354 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 FKBP8Q14318 412 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NGEFQ8N5V2 710 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 IFT57Q9NWB7 429 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 ERBB4Q15303 1308 aa14.66□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NBPF26B4DH59 902 aa14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 RGL2O15211 777 aa14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 TM4SF1P30408 202 aa14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NBPF15Q8N660 670 aa14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 HOXB7P09629 217 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 WWC1Q8IX03 1113 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.64□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 KLHL34Q8N239 644 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 UTRNP46939 3433 aa14.63□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CAMTA2O94983 1202 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 MBIPQ9NS73 344 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 IL16Q14005 1332 aa14.62□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 DDR1Q08345 913 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NFIXQ14938 502 aa14.61□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 TGFB2P61812 414 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 WDR63Q8IWG1 891 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.6□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.59□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 PDIA6Q15084 440 aa14.59□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 SCN7AQ01118 1682 aa14.58□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.58□□□□□ -0.07
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 SERPINB2P05120 415 aa14.58□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 KRT24Q2M2I5 525 aa14.58□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.58□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.58□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 SETDB2Q96T68 719 aa14.58□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.57□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 MYL6BP14649 208 aa14.57□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.57□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.57□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.57□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.56□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.56□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.56□□□□□ -0.08
TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 BCORQ6W2J9 1755 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms