RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527303.1

PLEC-211, Transcript of plectin, humanhuman

TSL 3

Gene PLEC, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-211ENST00000527303 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.29■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.29■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.28■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 CFAP53Q96M91 514 aa29.28■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 STARD3NLO95772 234 aa29.27■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 TEFQ10587 303 aa29.27■■■□□ 2.28
PLEC-211ENST00000527303 NRXN2Q9P2S2 1712 aa29.26■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.26■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 IL17REQ8NFR9 667 aa29.23■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 A0A087WZG4 1122 aa29.22■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 ZNF790Q6PG37 636 aa29.22■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 NUDCQ9Y266 331 aa29.22■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 KIF3CO14782 793 aa29.21■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
PLEC-211ENST00000527303 HSPA6P17066 643 aa29.2■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 NFIXQ14938 502 aa29.2■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.2■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.2■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 DLEC1Q9Y238 1755 aa29.19■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 SBF1O95248 1867 aa29.17■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.17■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.17■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.17■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 SERPINB2P05120 415 aa29.16■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 CHRNA5P30532 468 aa29.16■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 PRKAR2BP31323 418 aa29.16■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.15■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 SCN7AQ01118 1682 aa29.14■■■□□ 2.26
PLEC-211ENST00000527303 TOMM70O94826 608 aa29.13■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.13■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 PPP2R1AP30153 589 aa29.12■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.12■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 BTBD11A6QL63 1104 aa29.11■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 RNF181Q9P0P0 153 aa29.08■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.08■■■□□ 2.25
PLEC-211ENST00000527303 H0YIN7 160 aa29.07■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 TTLL6Q8N841 843 aa29.07■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 CARMIL3Q8ND23 1372 aa29.05■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.05■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.05■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa29.05■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 BCORQ6W2J9 1755 aa29.05■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.04■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.04■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 BRIP1Q9BX63 1249 aa29.04■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.04■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 A1BGP04217 495 aa29.03■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 PDE6BP35913 854 aa29.03■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 APLP1P51693 650 aa29.03■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.02■■■□□ 2.24
PLEC-211ENST00000527303 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 SETDB2Q96T68 719 aa29.01■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 KCNQ3O43525 872 aa29■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 LMNB1P20700 586 aa29■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 CAMTA2O94983 1202 aa28.99■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 MCM10Q7L590 875 aa28.99■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 RGL2O15211 777 aa28.98■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 NEFMP07197 916 aa28.98■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.98■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.98■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 USP16Q9Y5T5 823 aa28.98■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 FSTL1Q12841 308 aa28.97■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.96■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
PLEC-211ENST00000527303 RASSF7Q02833 373 aa28.95■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 CNBD1Q8NA66 436 aa28.95■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.95■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.95■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.94■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.94■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 ST5P78524 1137 aa28.94■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.223e-6■■□□□ 12.4
PLEC-211ENST00000527303 NPHP1O15259 732 aa28.93■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 RRAGCQ9HB90 399 aa28.93■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 GLTPD2A6NH11 291 aa28.92■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PLEC-211ENST00000527303 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.92■■■□□ 2.22
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