RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FKBP8Q14318 412 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NARFQ9UHQ1 456 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TM4SF1P30408 202 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCM10Q7L590 875 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL15A1P39059 1388 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WZG4 1122 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNQ3O43525 872 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDR1Q08345 913 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCTN1Q14203 1278 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0G2JLW4 131 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPEP1P16444 411 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFIXQ14938 502 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFE2L2Q16236 605 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP16Q9Y5T5 823 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A1BGP04217 495 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNA3P22001 575 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SERPINB2P05120 415 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIM2Q9P1W9 311 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCS1LQ9Y276 419 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMTA2O94983 1202 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIPK4P57078 832 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGL2O15211 777 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHRNA5P30532 468 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADCY9O60503 1353 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF26B4DH59 902 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF15Q8N660 670 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SETDB2Q96T68 719 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP10DQ9P241 1426 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RUNDC1Q96C34 613 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCN7AQ01118 1682 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H0YIN7 160 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE6BP35913 854 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1QTNF8P60827 252 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTLL6Q8N841 843 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNBD1Q8NA66 436 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERBB4Q15303 1308 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCORQ6W2J9 1755 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ST5P78524 1137 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEUROD2Q15784 382 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPHP1O15259 732 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 357.3 ms