RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496909.5

HDAC10-218, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC10, Length 732 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-218ENST00000496909 MMP10P09238 476 aa25.04■■□□□ 1.6
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HDAC10-218ENST00000496909 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
HDAC10-218ENST00000496909 RIPK4P57078 832 aa25.03■■□□□ 1.6
HDAC10-218ENST00000496909 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
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HDAC10-218ENST00000496909 KLHL34Q8N239 644 aa25.02■■□□□ 1.6
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HDAC10-218ENST00000496909 RUNDC1Q96C34 613 aa25.01■■□□□ 1.59
HDAC10-218ENST00000496909 A1BGP04217 495 aa25■■□□□ 1.59
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HDAC10-218ENST00000496909 COL15A1P39059 1388 aa24.97■■□□□ 1.59
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HDAC10-218ENST00000496909 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.97■■□□□ 1.59
HDAC10-218ENST00000496909 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.97■■□□□ 1.59
HDAC10-218ENST00000496909 ZPR1O75312 459 aa24.95■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 DDR1Q08345 913 aa24.95■■□□□ 1.58
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HDAC10-218ENST00000496909 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.93■■□□□ 1.58
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HDAC10-218ENST00000496909 NBPF26B4DH59 902 aa24.92■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.92■■□□□ 1.58
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HDAC10-218ENST00000496909 A0A087WZG4 1122 aa24.91■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.91■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 ANP32CO43423 234 aa24.9■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 NFIXQ14938 502 aa24.9■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.9■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.9■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 GPR162Q16538 588 aa24.89■■□□□ 1.58
HDAC10-218ENST00000496909 APAF1O14727 1248 aa24.88■■□□□ 1.57
HDAC10-218ENST00000496909 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.88■■□□□ 1.57
HDAC10-218ENST00000496909 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.87■■□□□ 1.57
HDAC10-218ENST00000496909 CHL1O00533 1208 aa24.87■■□□□ 1.57
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HDAC10-218ENST00000496909 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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HDAC10-218ENST00000496909 A0A0G2JLW4 131 aa24.83■■□□□ 1.57
HDAC10-218ENST00000496909 KCNA3P22001 575 aa24.83■■□□□ 1.57
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HDAC10-218ENST00000496909 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.83■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 MRS2Q9HD23 443 aa24.82■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 SERPINB2P05120 415 aa24.81■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 ZNF853P0CG23 659 aa24.8■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 DPEP1P16444 411 aa24.8■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 YY1P25490 414 aa24.8■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.8■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 KRT24Q2M2I5 525 aa24.79■■□□□ 1.56
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HDAC10-218ENST00000496909 CFAP44Q96MT7 982 aa24.79■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 GRIN3BO60391 1043 aa24.78■■□□□ 1.56
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HDAC10-218ENST00000496909 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.78■■□□□ 1.56
HDAC10-218ENST00000496909 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.78■■□□□ 1.56
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HDAC10-218ENST00000496909 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.75■■□□□ 1.55
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HDAC10-218ENST00000496909 MBIPQ9NS73 344 aa24.74■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 ERBB4Q15303 1308 aa24.74■■□□□ 1.55
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HDAC10-218ENST00000496909 CHRNA5P30532 468 aa24.73■■□□□ 1.55
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HDAC10-218ENST00000496909 SETDB2Q96T68 719 aa24.73■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 CCDC27Q2M243 656 aa24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 IFT57Q9NWB7 429 aa24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 SCN7AQ01118 1682 aa24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.71■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.71■■□□□ 1.55
HDAC10-218ENST00000496909 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HDAC10-218ENST00000496909 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.69■■□□□ 1.54
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