RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM5	Q71RC9	77 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	RUNDC1	Q96C34	613 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	COL15A1	P39059	1388 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	TJP1	Q07157	1748 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	NPHP1	O15259	732 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	GYS1	P13807	737 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	NARF	Q9UHQ1	456 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	NEUROD2	Q15784	382 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	TGFB2	P61812	414 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-231	ENST00000496246	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		14.83	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNQ3	O43525	872 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBP8	Q14318	412 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	A1BG	P04217	495 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	C4A	P0C0L4	1744 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	SETDB2	Q96T68	719 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	USP16	Q9Y5T5	823 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	MRS2	Q9HD23	443 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINB2	P05120	415 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	PIM2	Q9P1W9	311 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	CHD4	Q14839	1912 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	ERBB4	Q15303	1308 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	TM4SF1	P30408	202 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	ST5	P78524	1137 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	NFIX	Q14938	502 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	BCS1L	Q9Y276	419 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	RGL2	O15211	777 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0G2JLW4	131 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246		H0YIN7	160 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	DPEP1	P16444	411 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE6B	P35913	854 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	DDR1	Q08345	913 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	NGEF	Q8N5V2	710 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	CNBD1	Q8NA66	436 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	APAF1	O14727	1248 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	GNAI1	P63096	354 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	MYL6B	P14649	208 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP44	Q96MT7	982 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMTA2	O94983	1202 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	NYX	Q9GZU5	481 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		14.71	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	CHL1	O00533	1208 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXB7	P09629	217 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-231	ENST00000496246	IFT57	Q9NWB7	429 aa		14.7	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms