RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.84■■□□□ 1.89
NOM1-208ENST00000489850 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.84■■□□□ 1.89
NOM1-208ENST00000489850 RFC4P35249 363 aa26.83■■□□□ 1.89
NOM1-208ENST00000489850 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
NOM1-208ENST00000489850 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.83■■□□□ 1.89
NOM1-208ENST00000489850 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 SMIM5Q71RC9 77 aa26.81■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.81■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 ARXQ96QS3 562 aa26.8■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.8■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 MSL1Q68DK7 614 aa26.78■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 COL15A1P39059 1388 aa26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 CCER2I3L3R5 266 aa26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 CHL1O00533 1208 aa26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 CCDC27Q2M243 656 aa26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.77■■□□□ 1.88
NOM1-208ENST00000489850 A0A087WZG4 1122 aa26.76■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 CFAP44Q96MT7 982 aa26.76■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 USP16Q9Y5T5 823 aa26.76■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 ZPR1O75312 459 aa26.75■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 C4AP0C0L4 1744 aa26.74■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.73■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 A1BGP04217 495 aa26.73■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 NGEFQ8N5V2 710 aa26.73■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 IFT57Q9NWB7 429 aa26.73■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 GYS1P13807 737 aa26.72■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 NARFQ9UHQ1 456 aa26.72■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 GNAI1P63096 354 aa26.71■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.71■■□□□ 1.87
NOM1-208ENST00000489850 WWC1Q8IX03 1113 aa26.69■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 ZNF853P0CG23 659 aa26.68■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 ERBB4Q15303 1308 aa26.67■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 MMP10P09238 476 aa26.67■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.67■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 SYT17Q9BSW7 474 aa26.66■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 MBIPQ9NS73 344 aa26.66■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 HOXB7P09629 217 aa26.65■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 IL16Q14005 1332 aa26.65■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 FKBP8Q14318 412 aa26.64■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.64■■□□□ 1.86
NOM1-208ENST00000489850 NBPF26B4DH59 902 aa26.63■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 KLHL34Q8N239 644 aa26.63■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 NBPF15Q8N660 670 aa26.63■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.63■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.62■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 RGL2O15211 777 aa26.61■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 WDR63Q8IWG1 891 aa26.61■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.59■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.59■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.59■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 SCN7AQ01118 1682 aa26.59■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.58■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 TM4SF1P30408 202 aa26.58■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.58■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.58■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
NOM1-208ENST00000489850 CAMTA2O94983 1202 aa26.57■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 KRT24Q2M2I5 525 aa26.57■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.57■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 NFIXQ14938 502 aa26.56■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 MIER1Q8N108 512 aa26.56■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 MYL6BP14649 208 aa26.55■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.55■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.55■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 DDR1Q08345 913 aa26.54■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.53■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 BCORQ6W2J9 1755 aa26.53■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 PDIA6Q15084 440 aa26.52■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.52■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 SETDB2Q96T68 719 aa26.52■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NOM1-208ENST00000489850 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.51■■□□□ 1.83
NOM1-208ENST00000489850 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.51■■□□□ 1.83
NOM1-208ENST00000489850 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.51■■□□□ 1.83
NOM1-208ENST00000489850 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NOM1-208ENST00000489850 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.5■■□□□ 1.83
NOM1-208ENST00000489850 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.5■■□□□ 1.83
NOM1-208ENST00000489850 NECTIN2Q92692 538 aa26.5■■□□□ 1.83
NOM1-208ENST00000489850 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.5■■□□□ 1.83
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