RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 ANXA1P04083 346 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 ITGB4P16144 1822 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 KCPQ6ZWJ8 1503 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 USP16Q9Y5T5 823 aa33.86■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 BCL9O00512 1426 aa33.86■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 PROSER3Q2NL68 480 aa33.85■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 IGHDP01880 384 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 GLI3P10071 1580 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 A0A0G2JS52 829 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 MYT1Q01538 1121 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 PDIA6Q15084 440 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 KAT6BQ8WYB5 2073 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 ATG3Q9NT62 314 aa33.82■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 DOT1LQ8TEK3 1739 aa33.81■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 PXDNLA1KZ92 1463 aa33.81■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 LAMB4A4D0S4 1761 aa33.81■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 PI4KAP2A4QPH2 592 aa33.79■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa33.79■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 MYL6BP14649 208 aa33.78■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 ATRNO75882 1429 aa33.77■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 DDX58O95786 925 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 DNAAF4Q8WXU2 420 aa33.77■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 ERBB4Q15303 1308 aa33.77■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 VSIG10Q8N0Z9 540 aa33.76■■■■□ 3
HOXB3-210ENST00000489475 ACSBG1Q96GR2 724 aa33.75■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 C1orf115Q9H7X2 142 aa33.75■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 KSR2Q6VAB6 950 aa33.74■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa33.74■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 ADCY9O60503 1353 aa33.74■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 MEIS3Q99687 375 aa33.74■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa33.72■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa33.72■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 XAGE3Q8WTP9 111 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 LRP10Q7Z4F1 713 aa33.7■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
HOXB3-210ENST00000489475 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 COPS6Q7L5N1 327 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 GNAI3P08754 354 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 BEND3Q5T5X7 828 aa33.68■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 ATP10DQ9P241 1426 aa33.68■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 STARD3NLO95772 234 aa33.67■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 RIC3Q7Z5B4 369 aa33.67■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF26B4DH59 902 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 A1BGP04217 495 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF14Q5TI25 921 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJC10Q8IXB1 793 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF15Q8N660 670 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXB3-210ENST00000489475 GNAI2P04899 355 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 USP44Q9H0E7 712 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 KCNQ2O43526 872 aa33.62■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 ALDH1L1O75891 902 aa33.62■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 SIRT2Q8IXJ6 389 aa33.62■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 SEPT12Q8IYM1 358 aa33.61■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 SLC4A9Q96Q91 983 aa33.61■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD44Q8N8A2 993 aa33.6■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 LINS1Q8NG48 757 aa33.6■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 NEXNQ0ZGT2 675 aa33.6■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 CEP85Q6P2H3 762 aa33.6■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 SMC5Q8IY18 1101 aa33.6■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 SKAP1Q86WV1 359 aa33.59■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 PLBD2Q8NHP8 589 aa33.58■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
HOXB3-210ENST00000489475 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 PALLDQ8WX93 1383 aa33.56■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 GCC1Q96CN9 775 aa33.56■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa33.56■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 SIK1P57059 783 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 HMMRO75330 724 aa33.53■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 MYD88Q99836 296 aa33.53■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 ATP6V1AP38606 617 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 FAM182BQ5T319 152 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 TTLL7Q6ZT98 887 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 TJP1Q07157 1748 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 RGS3P49796 1198 aa33.51■■■□□ 2.96
HOXB3-210ENST00000489475 IGKV5-2P06315 115 aa33.51■■■□□ 2.95
HOXB3-210ENST00000489475 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms