RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 PTPRCP08575 1304 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
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NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 SLIT1O75093 1534 aa16.31■□□□□ 0.2
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NISCH-212ENST00000488380 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 ABTB2Q8N961 1025 aa16.28■□□□□ 0.2
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NISCH-212ENST00000488380 IL17REQ8NFR9 667 aa16.28■□□□□ 0.2
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NISCH-212ENST00000488380 KIF20AO95235 890 aa16.27■□□□□ 0.19
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NISCH-212ENST00000488380 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-212ENST00000488380 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
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NISCH-212ENST00000488380 PDE1AP54750 535 aa16.22■□□□□ 0.19
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NISCH-212ENST00000488380 HMMRO75330 724 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
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NISCH-212ENST00000488380 NBPF4Q96M43 638 aa16.19■□□□□ 0.18
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NISCH-212ENST00000488380 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 UVSSAQ2YD98 709 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.18■□□□□ 0.18
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NISCH-212ENST00000488380 LTN1O94822 1766 aa16.17■□□□□ 0.18
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NISCH-212ENST00000488380 ANXA1P04083 346 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 USP44Q9H0E7 712 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.16■□□□□ 0.18
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NISCH-212ENST00000488380 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 KDM4AO75164 1064 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 ATP8B2P98198 1209 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 OSBPL3Q9H4L5 887 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 MCM2P49736 904 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-212ENST00000488380 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 RILPL2Q969X0 211 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-212ENST00000488380 GNAI3P08754 354 aa16.14■□□□□ 0.17
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