RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 COL15A1P39059 1388 aa26.95■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R1AP30153 589 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.93e-42■□□□□ 8.5
ACTB-212ENST00000484841 IL17REQ8NFR9 667 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 PIM2Q9P1W9 311 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 DDR1Q08345 913 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 ZNF790Q6PG37 636 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 ADCY9O60503 1353 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 TM4SF1P30408 202 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 A0A087WZG4 1122 aa26.9■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.9■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 NEFMP07197 916 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-212ENST00000484841 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 BTBD11A6QL63 1104 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 NFIXQ14938 502 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 KCNA3P22001 575 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 SERPINB2P05120 415 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 CHRNA5P30532 468 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.83■■□□□ 1.89
ACTB-212ENST00000484841 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.8■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 MCM10Q7L590 875 aa26.79■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.79■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.79■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 NPHP1O15259 732 aa26.78■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 KCNQ3O43525 872 aa26.77■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.77■■□□□ 1.88
ACTB-212ENST00000484841 H0YIN7 160 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 A1BGP04217 495 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 SCN7AQ01118 1682 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.74■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 DCTN1Q14203 1278 aa26.73■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 TTLL6Q8N841 843 aa26.73■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 SETDB2Q96T68 719 aa26.73■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 RNF181Q9P0P0 153 aa26.73■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.73■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.72■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 KIF3CO14782 793 aa26.72■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 USP16Q9Y5T5 823 aa26.72■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 PDE6BP35913 854 aa26.71■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ACTB-212ENST00000484841 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 SBF1O95248 1867 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 HSPA6P17066 643 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 ST5P78524 1137 aa26.68■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.68■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 BCORQ6W2J9 1755 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 TOMM70O94826 608 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 CAMTA2O94983 1202 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 CNBD1Q8NA66 436 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.66■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.64■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.64■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.64■■□□□ 1.86
ACTB-212ENST00000484841 RASSF7Q02833 373 aa26.63■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.63■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 LMNB1P20700 586 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 RALBP1Q15311 655 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 NFE2L2Q16236 605 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.61■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.6■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 CNKSR1Q969H4 720 aa26.59■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ACTB-212ENST00000484841 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms