RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG4B-216ENST00000475195 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.69■■□□□ 1.06
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ATG4B-216ENST00000475195 RFC4P35249 363 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-216ENST00000475195 MSL1Q68DK7 614 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-216ENST00000475195 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-216ENST00000475195 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-216ENST00000475195 USP16Q9Y5T5 823 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-216ENST00000475195 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-216ENST00000475195 GYS1P13807 737 aa21.67■■□□□ 1.06
ATG4B-216ENST00000475195 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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ATG4B-216ENST00000475195 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
ATG4B-216ENST00000475195 NEUROD2Q15784 382 aa21.64■■□□□ 1.05
ATG4B-216ENST00000475195 MRS2Q9HD23 443 aa21.64■■□□□ 1.05
ATG4B-216ENST00000475195 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.63■■□□□ 1.05
ATG4B-216ENST00000475195 APAF1O14727 1248 aa21.63■■□□□ 1.05
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ATG4B-216ENST00000475195 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ATG4B-216ENST00000475195 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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ATG4B-216ENST00000475195 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-216ENST00000475195 COL15A1P39059 1388 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-216ENST00000475195 A0A087WZG4 1122 aa21.6■■□□□ 1.05
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ATG4B-216ENST00000475195 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.59■■□□□ 1.05
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ATG4B-216ENST00000475195 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.58■■□□□ 1.05
ATG4B-216ENST00000475195 CFAP44Q96MT7 982 aa21.57■■□□□ 1.04
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF26B4DH59 902 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF853P0CG23 659 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC27Q2M243 656 aa21.56■■□□□ 1.04
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ATG4B-216ENST00000475195 NBPF15Q8N660 670 aa21.56■■□□□ 1.04
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ATG4B-216ENST00000475195 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.54■■□□□ 1.04
ATG4B-216ENST00000475195 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-216ENST00000475195 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.53■■□□□ 1.04
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ATG4B-216ENST00000475195 DDR1Q08345 913 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-216ENST00000475195 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-216ENST00000475195 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 CAMTA2O94983 1202 aa21.51■■□□□ 1.03
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ATG4B-216ENST00000475195 NFIXQ14938 502 aa21.51■■□□□ 1.03
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ATG4B-216ENST00000475195 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 TGFB2P61812 414 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 GNAI1P63096 354 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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ATG4B-216ENST00000475195 PDIA6Q15084 440 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 WWC1Q8IX03 1113 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 MBIPQ9NS73 344 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 UTRNP46939 3433 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 HOXB7P09629 217 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 SCN7AQ01118 1682 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-216ENST00000475195 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.46■■□□□ 1.03
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ATG4B-216ENST00000475195 SERPINB2P05120 415 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 KRT24Q2M2I5 525 aa21.45■■□□□ 1.02
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ATG4B-216ENST00000475195 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 IL16Q14005 1332 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.43■■□□□ 1.02
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ATG4B-216ENST00000475195 WDR63Q8IWG1 891 aa21.42■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 HLFQ16534 295 aa21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 SETDB2Q96T68 719 aa21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-216ENST00000475195 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.4■■□□□ 1.02
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