RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468775.1

E2F6-208, Transcript of E2F transcription factor 6, human

TSL 2

Gene E2F6, Length 1,061 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F6-208	ENST00000468775	SCN7A	Q01118	1682 aa		29.12	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		29.11	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	MCM10	Q7L590	875 aa		29.1	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	BTBD11	A6QL63	1104 aa		29.09	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	FKBP8	Q14318	412 aa		29.09	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		29.09	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	KCNQ3	O43525	872 aa		29.08	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	GRIN3B	O60391	1043 aa		29.08	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	STARD3NL	O95772	234 aa		29.08	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	NARF	Q9UHQ1	456 aa		29.08	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.08	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29.08	■■■□□ 2.25
E2F6-208	ENST00000468775	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	TM4SF1	P30408	202 aa		29.06	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	TGFB2	P61812	414 aa		29.06	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	DCTN1	Q14203	1278 aa		29.06	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		29.06	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	DDR1	Q08345	913 aa		29.05	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		29.05	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		29.04	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		29.04	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	ZPR1	O75312	459 aa		29.03	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	NFE2L2	Q16236	605 aa		29.03	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
E2F6-208	ENST00000468775	NEFM	P07197	916 aa		29.01	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		29.01	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775		A0A087WZG4	1122 aa		28.97	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	NFIX	Q14938	502 aa		28.97	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.97	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	KCNA3	P22001	575 aa		28.96	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		28.95	■■■□□ 2.23
E2F6-208	ENST00000468775	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.95	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	A1BG	P04217	495 aa		28.95	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.94	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	ADCY9	O60503	1353 aa		28.93	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775		A0A0G2JLW4	131 aa		28.93	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	DPEP1	P16444	411 aa		28.93	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.9	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.89	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.89	■■■□□ 2.22
E2F6-208	ENST00000468775	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.88	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	NBPF26	B4DH59	902 aa		28.87	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	SERPINB2	P05120	415 aa		28.87	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	NBPF15	Q8N660	670 aa		28.87	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.86	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	RIPK4	P57078	832 aa		28.85	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.85	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	RGL2	O15211	777 aa		28.84	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.84	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	NUP98	P52948	1817 aa		28.83	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	SBF1	O95248	1867 aa		28.83	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		28.83	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.83	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
E2F6-208	ENST00000468775	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.82	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.81	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	CHRNA5	P30532	468 aa		28.81	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		28.81	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.81	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.81	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.79	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		28.79	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.78	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.77	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		28.77	■■■□□ 2.2
E2F6-208	ENST00000468775	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.75	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		28.75	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	ERBB4	Q15303	1308 aa		28.74	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.74	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.73	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.73	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.72	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		28.7	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		28.7	■■■□□ 2.19
E2F6-208	ENST00000468775	CHL1	O00533	1208 aa		28.7	■■■□□ 2.18

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