RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	DDR1	Q08345	913 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	STARD3NL	O95772	234 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF790	Q6PG37	636 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	ADCY9	O60503	1353 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	NARF	Q9UHQ1	456 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	FCHSD2	O94868	740 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	TM4SF1	P30408	202 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PRKCZ-208	ENST00000468310	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	PIM2	Q9P1W9	311 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	KCNA3	P22001	575 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	NFIX	Q14938	502 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310		A0A087WZG4	1122 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	CHRNA5	P30532	468 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	MCM10	Q7L590	875 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	KCNQ3	O43525	872 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PRKCZ-208	ENST00000468310	SERPINB2	P05120	415 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	SCN7A	Q01118	1682 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	NEFM	P07197	916 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	A1BG	P04217	495 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PRKCZ-208	ENST00000468310	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	USP16	Q9Y5T5	823 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
PRKCZ-208	ENST00000468310		H0YIN7	160 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	CAMTA2	O94983	1202 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	SETDB2	Q96T68	719 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	RNF181	Q9P0P0	153 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	KIF3C	O14782	793 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	NPHP1	O15259	732 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	TTLL6	Q8N841	843 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	SBF1	O95248	1867 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	PDE6B	P35913	854 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	RALBP1	Q15311	655 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	NFE2L2	Q16236	605 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNBD1	Q8NA66	436 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	RASSF7	Q02833	373 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	28.44	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	ST5	P78524	1137 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	NBPF26	B4DH59	902 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	NBPF15	Q8N660	670 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	HSPA6	P17066	643 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PRKCZ-208	ENST00000468310	CACNA1S	Q13698	1873 aa		28.38	■■■□□ 2.13

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