RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RUNDC1Q96C34 613 aa28.49■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.49■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GYS1P13807 737 aa28.48■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.48■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ANP32CO43423 234 aa28.47■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COL15A1P39059 1388 aa28.47■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MMP10P09238 476 aa28.46■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.46■■■□□ 2.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZPR1O75312 459 aa28.45■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.45■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.44■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.42■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A087WZG4 1122 aa28.41■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NEUROD2Q15784 382 aa28.41■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NARFQ9UHQ1 456 aa28.41■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.4■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FKBP8Q14318 412 aa28.39■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.39■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP16Q9Y5T5 823 aa28.39■■■□□ 2.14
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.38■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A1BGP04217 495 aa28.38■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.37■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GPR162Q16538 588 aa28.36■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.36■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC184Q52MB2 194 aa28.35■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.35■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.34■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MRS2Q9HD23 443 aa28.33■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.33■■■□□ 2.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SCN7AQ01118 1682 aa28.32■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.32■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 APAF1O14727 1248 aa28.3■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TM4SF1P30408 202 aa28.3■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DDR1Q08345 913 aa28.3■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.3■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.3■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NFIXQ14938 502 aa28.28■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BCORQ6W2J9 1755 aa28.27■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TGFB2P61812 414 aa28.26■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHD4Q14839 1912 aa28.26■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NBPF26B4DH59 902 aa28.25■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NBPF15Q8N660 670 aa28.25■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.24■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.24■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHL1O00533 1208 aa28.24■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CAMTA2O94983 1202 aa28.24■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GRIN3BO60391 1043 aa28.23■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.23■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.23■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 YY1P25490 414 aa28.22■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SERPINB2P05120 415 aa28.21■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.21■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.21■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ERBB4Q15303 1308 aa28.2■■■□□ 2.11
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CFAP44Q96MT7 982 aa28.2■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.19■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A0G2JLW4 131 aa28.18■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.18■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.18■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 UTRNP46939 3433 aa28.18■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RGL2O15211 777 aa28.17■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DPEP1P16444 411 aa28.17■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SETDB2Q96T68 719 aa28.17■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MYL6BP14649 208 aa28.16■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NGEFQ8N5V2 710 aa28.16■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IFT57Q9NWB7 429 aa28.16■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GNAI1P63096 354 aa28.15■■■□□ 2.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF853P0CG23 659 aa28.13■■■□□ 2.09
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.13■■■□□ 2.09
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MBIPQ9NS73 344 aa28.13■■■□□ 2.09
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NPHP1O15259 732 aa28.12■■■□□ 2.09
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC27Q2M243 656 aa28.12■■■□□ 2.09
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KRT24Q2M2I5 525 aa28.12■■■□□ 2.09
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HOXB7P09629 217 aa28.11■■■□□ 2.09
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