RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 FSHRP23945 695 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXC1Q12948 553 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADH1CP00326 375 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 A2MP01023 1474 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.96□□□□□ -1.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 CARNS1A5YM72 827 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L15C9J2P7 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L10C9JJH3 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L12C9JPN9 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L11C9JVI0 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L21D6R901 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L18D6R9N7 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L22D6RA61 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L19D6RCP7 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L20D6RJB6 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE2BO14633 110 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 GDF9O60383 454 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR3C2P08235 984 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASA1P20936 1047 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCTRP47872 440 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN10P78369 228 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP17L24Q0WX57 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC125Q86Z20 511 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOD1Q9Y239 953 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM196BA6NMK8 535 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH1A1P00352 501 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPA2P54652 639 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP4Q13107 963 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR5A1Q13285 461 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTK7Q13308 1070 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 OGFOD1Q8N543 542 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBD5Q9P267 1494 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K1Q13233 1512 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 DKK1O94907 266 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 J3QL48 77 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF10AO00220 468 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERVK-9P63128 1117 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF2IP78347 998 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM50Q86XT4 487 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK32AQ8WU08 396 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIRT1Q96EB6 747 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEPDC5O75140 1603 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 LILRA1O75019 489 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP1A2P50993 1020 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 NNTQ13423 1086 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYLDQ9NQC7 956 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 USTQ9Y2C2 406 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.92□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFRA3O60609 400 aa6.91□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPYDQ12882 1025 aa6.91□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.91□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.91□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.91□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 175 ms