RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430390.5

TTLL3-211, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 1,674 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-211ENST00000430390 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 KCNQ3O43525 872 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 EP400Q96L91 3159 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 CABP4P57796 275 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-211ENST00000430390 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.14■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 BCL9O00512 1426 aa15.14■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 KCNQ2O43526 872 aa15.14■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 C5P01031 1676 aa15.13■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.13■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.12■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.12■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 FLIIQ13045 1269 aa15.12■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.12■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ITGB4P16144 1822 aa15.11■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PLSCR1O15162 318 aa15.11■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 G2E3Q7L622 706 aa15.11■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.11■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.11■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 SLC39A6Q13433 755 aa15.1■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.09■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.09■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.09■□□□□ 0.01
TTLL3-211ENST00000430390 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 NECTIN2Q92692 538 aa15.08■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 NBPF14Q5TI25 921 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 HYPKQ9NX55 129 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 IGHDP01880 384 aa15.06■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 ERBB4Q15303 1308 aa15.06■□□□□ 0
TTLL3-211ENST00000430390 TXNRD1Q16881 649 aa15.05■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.04■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 ATP10DQ9P241 1426 aa15.04■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 F6X3S4 739 aa15.03■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 PDIA6Q15084 440 aa15.03■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.03■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 PROM2Q8N271 834 aa15.03■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 PIGBQ92521 554 aa15.03■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
TTLL3-211ENST00000430390 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.02□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ADCY9O60503 1353 aa15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PROSER3Q2NL68 480 aa15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 USP16Q9Y5T5 823 aa15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 GNAI3P08754 354 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 KSR2Q6VAB6 950 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ANXA1P04083 346 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 LRP10Q7Z4F1 713 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 SMC5Q8IY18 1101 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ATG3Q9NT62 314 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 SBF2Q86WG5 1849 aa14.99□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 MEIS3Q99687 375 aa14.99□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.99□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 STK32BQ9NY57 414 aa14.99□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.99□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 NHSQ6T4R5 1651 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 BEND3Q5T5X7 828 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ALDH1L1O75891 902 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 GCC1Q96CN9 775 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 KCNQ4P56696 695 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-211ENST00000430390 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109 ms