RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 TJP1Q07157 1748 aa11.2□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP10P09238 476 aa11.19□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 RIPK4P57078 832 aa11.19□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 NARFQ9UHQ1 456 aa11.19□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.19□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 GRIN3BO60391 1043 aa11.18□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF5P55010 431 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 DCTN1Q14203 1278 aa11.18□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR162Q16538 588 aa11.18□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM5Q71RC9 77 aa11.18□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 ANP32CO43423 234 aa11.17□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 CANXP27824 592 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 TGFB2P61812 414 aa11.17□□□□□ -0.62
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MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.17□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.17□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 COL15A1P39059 1388 aa11.16□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 RGL2O15211 777 aa11.16□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNQ3O43525 872 aa11.16□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 TM4SF1P30408 202 aa11.15□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 FKBP8Q14318 412 aa11.15□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.15□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.15□□□□□ -0.62
MT-TS1-201ENST00000387416 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
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MT-TS1-201ENST00000387416 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.14□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 USP16Q9Y5T5 823 aa11.14□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 C4AP0C0L4 1744 aa11.13□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 YY1P25490 414 aa11.13□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.13□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.13□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.13□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CHD4Q14839 1912 aa11.13□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 ERBB4Q15303 1308 aa11.12□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 NEUROD2Q15784 382 aa11.12□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.12□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.12□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CHL1O00533 1208 aa11.11□□□□□ -0.63
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MT-TS1-201ENST00000387416 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.11□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.1□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CAMTA2O94983 1202 aa11.1□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINB2P05120 415 aa11.1□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CFAP44Q96MT7 982 aa11.1□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 SETDB2Q96T68 719 aa11.1□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.1□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.09□□□□□ -0.63
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MT-TS1-201ENST00000387416 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.09□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 APAF1O14727 1248 aa11.09□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 GNAI1P63096 354 aa11.09□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 NBPF15Q8N660 670 aa11.09□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 MRS2Q9HD23 443 aa11.09□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 PIM2Q9P1W9 311 aa11.09□□□□□ -0.63
MT-TS1-201ENST00000387416 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.08□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0G2JLW4 131 aa11.08□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 HOXB7P09629 217 aa11.08□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 DPEP1P16444 411 aa11.08□□□□□ -0.64
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MT-TS1-201ENST00000387416 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 PDE6BP35913 854 aa11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC27Q2M243 656 aa11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 IFT57Q9NWB7 429 aa11.07□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.06□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 H0YIN7 160 aa11.06□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 NPHP1O15259 732 aa11.06□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.06□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 BCS1LQ9Y276 419 aa11.06□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 SCN7AQ01118 1682 aa11.05□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF853P0CG23 659 aa11.05□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNA3P22001 575 aa11.05□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
MT-TS1-201ENST00000387416 ST5P78524 1137 aa11.05□□□□□ -0.64
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