RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
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PITX3-201ENST00000370002 COL15A1P39059 1388 aa26.95■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 TM4SF1P30408 202 aa26.95■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.94■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 MCM10Q7L590 875 aa26.93■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.92■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
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PITX3-201ENST00000370002 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 NFE2L2Q16236 605 aa26.89■■□□□ 1.9
PITX3-201ENST00000370002 C4AP0C0L4 1744 aa26.89■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.88■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 DDR1Q08345 913 aa26.88■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.88■■□□□ 1.89
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PITX3-201ENST00000370002 KCNQ3O43525 872 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 DCTN1Q14203 1278 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 CHD4Q14839 1912 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 NFIXQ14938 502 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 A0A0G2JLW4 131 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 USP16Q9Y5T5 823 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX3-201ENST00000370002 RGL2O15211 777 aa26.83■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 DPEP1P16444 411 aa26.83■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 A1BGP04217 495 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 KCNA3P22001 575 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 PIM2Q9P1W9 311 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 SERPINB2P05120 415 aa26.8■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.8■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 BCS1LQ9Y276 419 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.78■■□□□ 1.88
PITX3-201ENST00000370002 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.77■■□□□ 1.88
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PITX3-201ENST00000370002 RIPK4P57078 832 aa26.75■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.73■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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PITX3-201ENST00000370002 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
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PITX3-201ENST00000370002 ADCY9O60503 1353 aa26.73■■□□□ 1.87
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PITX3-201ENST00000370002 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.72■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 RUNDC1Q96C34 613 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.71■■□□□ 1.87
PITX3-201ENST00000370002 NBPF26B4DH59 902 aa26.7■■□□□ 1.86
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PITX3-201ENST00000370002 NBPF15Q8N660 670 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX3-201ENST00000370002 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX3-201ENST00000370002 CHRNA5P30532 468 aa26.69■■□□□ 1.86
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.69■■□□□ 1.86
PITX3-201ENST00000370002 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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PITX3-201ENST00000370002 H0YIN7 160 aa26.68■■□□□ 1.86
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PITX3-201ENST00000370002 ATP10DQ9P241 1426 aa26.67■■□□□ 1.86
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PITX3-201ENST00000370002 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.66■■□□□ 1.86
PITX3-201ENST00000370002 SCN7AQ01118 1682 aa26.65■■□□□ 1.86
PITX3-201ENST00000370002 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.65■■□□□ 1.86
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PITX3-201ENST00000370002 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
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PITX3-201ENST00000370002 CHL1O00533 1208 aa26.6■■□□□ 1.85
PITX3-201ENST00000370002 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.6■■□□□ 1.85
PITX3-201ENST00000370002 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.6■■□□□ 1.85
PITX3-201ENST00000370002 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.6■■□□□ 1.85
PITX3-201ENST00000370002 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PITX3-201ENST00000370002 NPHP1O15259 732 aa26.59■■□□□ 1.85
PITX3-201ENST00000370002 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PITX3-201ENST00000370002 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.59■■□□□ 1.85
PITX3-201ENST00000370002 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.84
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