RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
ECHS1-201ENST00000368547 NECTIN2Q92692 538 aa38.08■■■■□ 3.69
ECHS1-201ENST00000368547 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa38.07■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 STARD3NLO95772 234 aa38.06■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00116Q8NCU8 138 aa38.06■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 RREB1Q92766 1687 aa38.05■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa38.03■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 C4BP0C0L5 1744 aa38.02■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
ECHS1-201ENST00000368547 CRKLP46109 303 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC30Q5VVM6 783 aa38■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 A1BGP04217 495 aa37.99■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 CHMP4AQ9BY43 222 aa37.99■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 NUP188Q5SRE5 1749 aa37.98■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF428Q96B54 188 aa37.98■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC87Q9NVE4 849 aa37.97■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa37.96■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 CHPF2Q9P2E5 772 aa37.96■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 ERBB4Q15303 1308 aa37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF26B4DH59 902 aa37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 PDIA6Q15084 440 aa37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF14Q5TI25 921 aa37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF15Q8N660 670 aa37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 STK31Q9BXU1 1019 aa37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 CANXP27824 592 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 RARSP54136 660 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 ANXA1P04083 346 aa37.92■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 PROSER3Q2NL68 480 aa37.92■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 SSH1Q8WYL5 1049 aa37.92■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 CACNA1FO60840 1977 aa37.92■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 MYL6BP14649 208 aa37.91■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 ALDH1L2Q3SY69 923 aa37.91■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 BCL2L13Q9BXK5 485 aa37.91■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 AK7Q96M32 723 aa37.9■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 SLC4A2P04920 1241 aa37.89■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 RCAN3Q9UKA8 241 aa37.89■■■■□ 3.66
ECHS1-201ENST00000368547 GNPATO15228 680 aa37.88■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 SMC4Q9NTJ3 1288 aa37.88■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 UBR3Q6ZT12 1888 aa37.87■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF827Q17R98 1081 aa37.86■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 RNF123Q5XPI4 1314 aa37.86■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 LRP10Q7Z4F1 713 aa37.85■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 AKT1S1Q96B36 256 aa37.85■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 HYPKQ9NX55 129 aa37.85■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 RPS6KA4O75676 772 aa37.84■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 BCAR3O75815 825 aa37.84■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 NEFLP07196 543 aa37.84■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa37.83■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
ECHS1-201ENST00000368547 EIF5P55010 431 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 AMIGO3Q86WK7 504 aa37.82■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM5Q71RC9 77 aa37.81■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 G2E3Q7L622 706 aa37.8■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa37.79■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 COL15A1P39059 1388 aa37.79■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 STK32BQ9NY57 414 aa37.79■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 SLC15A2Q16348 729 aa37.78■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 PHF14O94880 888 aa37.77■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 COPS6Q7L5N1 327 aa37.77■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 XAGE3Q8WTP9 111 aa37.77■■■■□ 3.64
ECHS1-201ENST00000368547 FLIIQ13045 1269 aa37.76■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 C4AP0C0L4 1744 aa37.74■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 SSFA2P28290 1259 aa37.74■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 ARXQ96QS3 562 aa37.74■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 TTLL7Q6ZT98 887 aa37.73■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 QSER1Q2KHR3 1735 aa37.72■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC3LQ5T215 181 aa37.72■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 KIF16BQ96L93 1317 aa37.72■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 ADRA2BP18089 450 aa37.72■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa37.72■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 A0A087WZG4 1122 aa37.71■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
ECHS1-201ENST00000368547 KIF6Q6ZMV9 814 aa37.69■■■■□ 3.62
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRCP08575 1304 aa37.67■■■■□ 3.62
ECHS1-201ENST00000368547 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa37.67■■■■□ 3.62
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