RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.2■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0G2JS52 829 aa22.2■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 DCTPP1Q9H773 170 aa22.2■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.19■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.19■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 GNAI2P04899 355 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 PDIA6Q15084 440 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 GCC1Q96CN9 775 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 DCAF5Q96JK2 942 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 ADCY9O60503 1353 aa22.18■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 IL2RBP14784 551 aa22.17■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.17■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.17■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 BEND3Q5T5X7 828 aa22.16■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 COPS6Q7L5N1 327 aa22.14■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.14■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.14■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.14■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 EP400Q96L91 3159 aa22.14■■□□□ 1.14
PDE4D-204ENST00000358923 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.14■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 A1BGP04217 495 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 CLCN1P35523 988 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.1■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.1■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 SRGAP3O43295 1099 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 GNAI3P08754 354 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 HOXB7P09629 217 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 ARXQ96QS3 562 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 KSR2Q6VAB6 950 aa22.08■■□□□ 1.13
PDE4D-204ENST00000358923 ATP8B2P98198 1209 aa22.08■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.08■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.08■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 MYD88Q99836 296 aa22.07■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 IGKV5-2P06315 115 aa22.07■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF26B4DH59 902 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF14Q5TI25 921 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF15Q8N660 670 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 HMMRO75330 724 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 HYPKQ9NX55 129 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 ABCA3Q99758 1704 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 PIGBQ92521 554 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 C5P01031 1676 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 KAZALD1Q96I82 304 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 SUCLG2Q96I99 432 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 SIL1Q9H173 461 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4D-204ENST00000358923 SDSP20132 328 aa22.02■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 FGD1P98174 961 aa22.02■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.02■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.01■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.01■■□□□ 1.11
PDE4D-204ENST00000358923 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms