RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 BEND3Q5T5X7 828 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 KSR2Q6VAB6 950 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 USP44Q9H0E7 712 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.01■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 C8orf34Q49A92 452 aa24■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 DCTPP1Q9H773 170 aa24■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 NRAPQ86VF7 1730 aa24■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.99■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 MYL6BP14649 208 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 CERKQ8TCT0 537 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 LNPKQ9C0E8 428 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 JCADQ9P266 1359 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 SLIT2O94813 1529 aa23.98■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 GLI3P10071 1580 aa23.97■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 HMMRO75330 724 aa23.96■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.96■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 PAPPAQ13219 1627 aa23.96■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.95■■□□□ 1.43
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 TNS2Q63HR2 1409 aa23.95■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.94■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 PIGBQ92521 554 aa23.94■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 COPS6Q7L5N1 327 aa23.94■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.94■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 ALDH1L1O75891 902 aa23.92■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 ATP8B2P98198 1209 aa23.92■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.92■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 DDB1Q16531 1140 aa23.92■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.92■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 ERBB4Q15303 1308 aa23.91■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.91■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 LINS1Q8NG48 757 aa23.91■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 NGLY1Q96IV0 654 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 C8orf37Q96NL8 207 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 BARGINQ6ZT62 677 aa23.9■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 LRP6O75581 1613 aa23.89■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.89■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 ATG3Q9NT62 314 aa23.89■■□□□ 1.42
UPP1-201ENST00000331803 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.88■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 ITGB4P16144 1822 aa23.88■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 BCL9O00512 1426 aa23.88■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.87■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 NBPF26B4DH59 902 aa23.87■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 NBPF14Q5TI25 921 aa23.87■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 NBPF15Q8N660 670 aa23.87■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.86■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 A1BGP04217 495 aa23.86■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.86■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.85■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 IGKV5-2P06315 115 aa23.85■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 APBB1O00213 710 aa23.84■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 VPS72Q15906 364 aa23.84■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 SSH3Q8TE77 659 aa23.84■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.84■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 GRM8O00222 908 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 MYD88Q99836 296 aa23.83■■□□□ 1.41
UPP1-201ENST00000331803 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.82■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 UTYO14607 1347 aa23.82■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.82■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 POLA2Q14181 598 aa23.81■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.8■■□□□ 1.4
UPP1-201ENST00000331803 SRGAP3O43295 1099 aa23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms