RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 METP08581 1390 aa26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 STX6O43752 255 aa26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.891e-7■■■■■ 28.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE2HP62256 183 aa26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 STK31Q9BXU1 1019 aa26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.83■■□□□ 1.89
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNAI3P08754 354 aa26.83■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 RUFY3Q7L099 469 aa26.82■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF3AQ9Y496 699 aa26.82■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP2B3Q16720 1220 aa26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPC24Q8NBT2 197 aa26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC14Q96N46 770 aa26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.81■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.8■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 LARGE1O95461 756 aa26.8■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 F13A1P00488 732 aa26.8■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.8■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.79■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP44Q9H0E7 712 aa26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPG7Q9UQ90 795 aa26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.78■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.77■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAD50Q92878 1312 aa26.77■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 C3P01024 1663 aa26.77■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 SGSM2O43147 1006 aa26.77■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 DMTNQ08495 405 aa26.77■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.76■■□□□ 1.88
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.76■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.76■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.75■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.74■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.74■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 GJB2P29033 226 aa26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.73■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 PEAK1Q9H792 1746 aa26.72■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACEP12821 1306 aa26.72■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.72■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTMR6Q9Y217 621 aa26.71■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 AOX1Q06278 1338 aa26.7■■□□□ 1.87
GRAMD1A-201ENST00000317991 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.7■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 SSH3Q8TE77 659 aa26.7■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGLP35573 1532 aa26.7■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 HYPKQ9NX55 129 aa26.7■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 AKAP12Q02952 1782 aa26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.69■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF10O15013 1369 aa26.67■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAMK4Q16566 473 aa26.67■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITSN1Q15811 1721 aa26.67■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.67■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.67■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTGS1P23219 599 aa26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.863e-8■■■■□ 20.8
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTH1RQ03431 593 aa26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 NECAB1Q8N987 351 aa26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 EYA1Q99502 592 aa26.66■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRGAP3O43295 1099 aa26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 ST3GAL1Q11201 340 aa26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNTROBQ8N137 903 aa26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 FERMT3Q86UX7 667 aa26.64■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.64■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.64■■□□□ 1.86
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC192P0DO97 292 aa26.63■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 LUZP1Q86V48 1076 aa26.63■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.63■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAB11FIP3O75154 756 aa26.62■■□□□ 1.85
GRAMD1A-201ENST00000317991 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms