RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 JMYQ8N9B5 988 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 FANCAO15360 1455 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 KRT222Q8N1A0 295 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 PRM3Q9NNZ6 103 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 PLCH2O75038 1416 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD1Q15327 319 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 FBXO3Q9UK99 471 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 LMAN1P49257 510 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 PDE1AP54750 535 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 AACSQ86V21 672 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 CBFA2T2O43439 604 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC181Q5TID7 509 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 USP26Q9BXU7 913 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 FOXO3O43524 673 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 FLIIQ13045 1269 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 ODF2Q5BJF6 829 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 DCTPP1Q9H773 170 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 CNPY2Q9Y2B0 182 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 PSME1Q06323 249 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.21■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.21■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.21■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.21■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 TMX1Q9H3N1 280 aa18.21■□□□□ 0.51
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 HIP1O00291 1037 aa18.21■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 CEP85Q6P2H3 762 aa18.21■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 NSD2O96028 1365 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 RAD21O60216 631 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 USP48Q86UV5 1035 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 PLA2R1Q13018 1463 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF165P49910 485 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 NECAB1Q8N987 351 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 INSRP06213 1382 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 WASLO00401 505 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 MYL6BP14649 208 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 CPA1P15085 419 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 PTPRTO14522 1441 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 BOLA2Q9H3K6 86 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 EPS15P42566 896 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 GBP3Q9H0R5 595 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 SMTNL1A8MU46 457 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 CEP135Q66GS9 1140 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 G2E3Q7L622 706 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 SHTN1A0MZ66 631 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 XBP1P17861 261 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 MTMR7Q9Y216 660 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 ZSCAN12O43309 604 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 ANO10Q9NW15 660 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 FSD2A1L4K1 749 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 STX6O43752 255 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 TSC1Q92574 1164 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 RAB11FIP3O75154 756 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 MNAT1P51948 309 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 GJB2P29033 226 aa18.15■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
KCNS1-201ENST00000306117 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms