RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 NARFQ9UHQ1 456 aa24.99■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 TGFB2P61812 414 aa24.97■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 FKBP8Q14318 412 aa24.97■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 COL15A1P39059 1388 aa24.96■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 KCNQ3O43525 872 aa24.96■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.96■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.96■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 TJP1Q07157 1748 aa24.95■■□□□ 1.59
MALSU1-201ENST00000287543 TM4SF1P30408 202 aa24.93■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 RIPK4P57078 832 aa24.93■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 RUNDC1Q96C34 613 aa24.91■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 A1BGP04217 495 aa24.9■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.589e-7■□□□□ 11.3
MALSU1-201ENST00000287543 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.9■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 USP16Q9Y5T5 823 aa24.9■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
MALSU1-201ENST00000287543 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.89■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.88■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 DDR1Q08345 913 aa24.88■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.88■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.88■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 NFIXQ14938 502 aa24.87■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.86■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.85■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.84■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 A0A0G2JLW4 131 aa24.83■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.83■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 SERPINB2P05120 415 aa24.83■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.83■■□□□ 1.57
MALSU1-201ENST00000287543 RGL2O15211 777 aa24.82■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 C4AP0C0L4 1744 aa24.82■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 DPEP1P16444 411 aa24.82■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.82■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 CAMTA2O94983 1202 aa24.81■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 NEUROD2Q15784 382 aa24.81■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.81■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.81■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 PIM2Q9P1W9 311 aa24.8■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.79■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 SETDB2Q96T68 719 aa24.79■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 BCS1LQ9Y276 419 aa24.79■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 ANP32CO43423 234 aa24.78■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.78■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.78■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 NBPF26B4DH59 902 aa24.77■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 NBPF15Q8N660 670 aa24.77■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.77■■□□□ 1.56
MALSU1-201ENST00000287543 KCNA3P22001 575 aa24.76■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 ERBB4Q15303 1308 aa24.76■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.76■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.75■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 CHL1O00533 1208 aa24.73■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 NPHP1O15259 732 aa24.73■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.73■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 H0YIN7 160 aa24.72■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 PDE6BP35913 854 aa24.72■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.71■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 APAF1O14727 1248 aa24.71■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 CHRNA5P30532 468 aa24.71■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 CNBD1Q8NA66 436 aa24.71■■□□□ 1.55
MALSU1-201ENST00000287543 ST5P78524 1137 aa24.7■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.7■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.7■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.7■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.69■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.69■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 CFAP44Q96MT7 982 aa24.69■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.68■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 MYL6BP14649 208 aa24.67■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 NGEFQ8N5V2 710 aa24.67■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 TTLL6Q8N841 843 aa24.67■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 UTRNP46939 3433 aa24.67■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.66■■□□□ 1.54
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