RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286428.5

VBP1-201, Transcript of VHL binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VBP1, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1-201ENST00000286428 ERBB4Q15303 1308 aa23.59■■□□□ 1.37
VBP1-201ENST00000286428 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
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VBP1-201ENST00000286428 USP35Q9P2H5 1018 aa23.56■■□□□ 1.36
VBP1-201ENST00000286428 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.56■■□□□ 1.36
VBP1-201ENST00000286428 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
VBP1-201ENST00000286428 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
VBP1-201ENST00000286428 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.55■■□□□ 1.36
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VBP1-201ENST00000286428 LINS1Q8NG48 757 aa23.54■■□□□ 1.36
VBP1-201ENST00000286428 ADCY9O60503 1353 aa23.54■■□□□ 1.36
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VBP1-201ENST00000286428 ANXA1P04083 346 aa23.53■■□□□ 1.36
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VBP1-201ENST00000286428 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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VBP1-201ENST00000286428 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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VBP1-201ENST00000286428 USP16Q9Y5T5 823 aa23.51■■□□□ 1.35
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VBP1-201ENST00000286428 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.48■■□□□ 1.35
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VBP1-201ENST00000286428 COPS6Q7L5N1 327 aa23.48■■□□□ 1.35
VBP1-201ENST00000286428 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.48■■□□□ 1.35
VBP1-201ENST00000286428 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.48■■□□□ 1.35
VBP1-201ENST00000286428 ADAMTS2O95450 1211 aa23.47■■□□□ 1.35
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VBP1-201ENST00000286428 UTYO14607 1347 aa23.45■■□□□ 1.35
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VBP1-201ENST00000286428 MTX1Q13505 466 aa23.44■■□□□ 1.34
VBP1-201ENST00000286428 POLA2Q14181 598 aa23.44■■□□□ 1.34
VBP1-201ENST00000286428 MSH5O43196 834 aa23.44■■□□□ 1.34
VBP1-201ENST00000286428 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.44■■□□□ 1.34
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VBP1-201ENST00000286428 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.43■■□□□ 1.34
VBP1-201ENST00000286428 SRGAP3O43295 1099 aa23.43■■□□□ 1.34
VBP1-201ENST00000286428 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.43■■□□□ 1.34
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VBP1-201ENST00000286428 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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VBP1-201ENST00000286428 LRP6O75581 1613 aa23.4■■□□□ 1.34
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VBP1-201ENST00000286428 DDB1Q16531 1140 aa23.4■■□□□ 1.34
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VBP1-201ENST00000286428 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.39■■□□□ 1.34
VBP1-201ENST00000286428 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.39■■□□□ 1.34
VBP1-201ENST00000286428 MYD88Q99836 296 aa23.39■■□□□ 1.34
VBP1-201ENST00000286428 JCADQ9P266 1359 aa23.39■■□□□ 1.34
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VBP1-201ENST00000286428 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.38■■□□□ 1.33
VBP1-201ENST00000286428 PAPPAQ13219 1627 aa23.38■■□□□ 1.33
VBP1-201ENST00000286428 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.38■■□□□ 1.33
VBP1-201ENST00000286428 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.37■■□□□ 1.33
VBP1-201ENST00000286428 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.37■■□□□ 1.33
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VBP1-201ENST00000286428 BECN1Q14457 450 aa23.37■■□□□ 1.33
VBP1-201ENST00000286428 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VBP1-201ENST00000286428 SLIT2O94813 1529 aa23.36■■□□□ 1.33
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VBP1-201ENST00000286428 AOX1Q06278 1338 aa23.35■■□□□ 1.33
VBP1-201ENST00000286428 BCL9O00512 1426 aa23.35■■□□□ 1.33
VBP1-201ENST00000286428 PDE1AP54750 535 aa23.35■■□□□ 1.33
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