RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283148.11

UXS1-201, Transcript of UDP-glucuronate decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene UXS1, Length 2,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UXS1-201ENST00000283148 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 SDSP20132 328 aa28.72■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 SLC39A6Q13433 755 aa28.72■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.72■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.72■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 PDE1AP54750 535 aa28.71■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 DCAF5Q96JK2 942 aa28.71■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 KIF2CQ99661 725 aa28.71■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 POLA2Q14181 598 aa28.7■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 PDIA6Q15084 440 aa28.7■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 HYPKQ9NX55 129 aa28.7■■■□□ 2.19
UXS1-201ENST00000283148 KSR2Q6VAB6 950 aa28.7■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.69■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.68■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.68■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.68■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 C5P01031 1676 aa28.67■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 ALDH1L1O75891 902 aa28.65■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 SNX21Q969T3 373 aa28.65■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 ABCA3Q99758 1704 aa28.64■■■□□ 2.18
UXS1-201ENST00000283148 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 SRGAP3O43295 1099 aa28.62■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 MX1P20591 662 aa28.62■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 STAP2Q9UGK3 403 aa28.62■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 RAB11FIP3O75154 756 aa28.61■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 MTX1Q13505 466 aa28.61■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.6■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.6■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 HSCBQ8IWL3 235 aa28.6■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.6■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.59■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 LINS1Q8NG48 757 aa28.59■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 USP26Q9BXU7 913 aa28.58■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 CASC1Q6TDU7 716 aa28.58■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.58■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.58■■■□□ 2.17
UXS1-201ENST00000283148 CABP4P57796 275 aa28.57■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 GLI3P10071 1580 aa28.57■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 USP16Q9Y5T5 823 aa28.57■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 UTYO14607 1347 aa28.56■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.56■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.56■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.56■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.56■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.55■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.55■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.55■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 AOX1Q06278 1338 aa28.55■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 MYL6BP14649 208 aa28.54■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.54■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 GRM8O00222 908 aa28.53■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 IGKV5-2P06315 115 aa28.53■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.53■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 COPS6Q7L5N1 327 aa28.52■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.52■■■□□ 2.16
UXS1-201ENST00000283148 IL2RBP14784 551 aa28.51■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.51■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 KAZALD1Q96I82 304 aa28.51■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.5■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 ERC2O15083 957 aa28.5■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 REC8O95072 547 aa28.49■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.49■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 DDIT3P35638 169 aa28.49■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 SUCLG2Q96I99 432 aa28.49■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.49■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.48■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.47■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 STRN4Q9NRL3 753 aa28.47■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.47■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.47■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.46■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.46■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.46■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 RABEP1Q15276 862 aa28.46■■■□□ 2.15
UXS1-201ENST00000283148 CHMLP26374 656 aa28.45■■■□□ 2.14
UXS1-201ENST00000283148 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.45■■■□□ 2.14
UXS1-201ENST00000283148 GCKRQ14397 625 aa28.44■■■□□ 2.14
UXS1-201ENST00000283148 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.44■■■□□ 2.14
UXS1-201ENST00000283148 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 300.2 ms