RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5-201ENST00000258098 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SNX21Q969T3 373 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HSPA2P54652 639 aa23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SBNO1A3KN83 1393 aa23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CPLX1O14810 134 aa23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MBD3O95983 291 aa23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PSMA5P28066 241 aa23.2■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.31
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ESPNB1AK53 854 aa23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IP6K1Q92551 441 aa23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF853P0CG23 659 aa23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NECAB1Q8N987 351 aa23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HYPKQ9NX55 129 aa23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RTL1A6NKG5 1358 aa23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TSPY26PQ9H489 355 aa23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SNRKQ9NRH2 765 aa23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHMLP26374 656 aa23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.16■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PKP1Q13835 747 aa23.16■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SPC24Q8NBT2 197 aa23.16■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LAMC1P11047 1609 aa23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BECN2A8MW95 431 aa23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 USP44Q9H0E7 712 aa23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KIF3AQ9Y496 699 aa23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GPTP24298 496 aa23.14■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.14■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.14■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.14■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.14■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CAMK4Q16566 473 aa23.14■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IQGAP1P46940 1657 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GRM8O00222 908 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KSR2Q6VAB6 950 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ALKQ9UM73 1620 aa23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HIP1O00291 1037 aa23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRDNQ13061 729 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GUCY1B3Q02153 619 aa23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATP2B1P20020 1258 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATP7BP35670 1465 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PALD1Q9ULE6 856 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GOLIM4O00461 696 aa23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 USP6P35125 1406 aa23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GJB2P29033 226 aa23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PROSER3Q2NL68 480 aa23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF592Q92610 1267 aa23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SIRT1Q96EB6 747 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms