RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038107.8

Cited2-201, Transcript of Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cited2, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2-201ENSMUST00000038107 Speer4bQ9D9F7 267 aa28.69■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hoxa7P02830 229 aa28.68■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa28.68■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cnnm1Q0GA42 951 aa28.67■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Map3k13Q1HKZ5 959 aa28.67■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa28.67■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa28.66■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm7361D3Z6R1 267 aa28.66■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa28.66■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm1979E9QAN3 267 aa28.66■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm5862K7N5V5 267 aa28.66■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm10220K7N660 267 aa28.66■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Acsbg1Q99PU5 721 aa28.66■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Terf2O35144 541 aa28.65■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Slc5a1Q8C3K6 665 aa28.65■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Q9D2X8 372 aa28.65■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tceal9Q9DD24 104 aa28.65■■■□□ 2.18
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa28.64■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mum1Q6DID5 682 aa28.63■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Prkab2Q6PAM0 271 aa28.63■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hmox1P14901 289 aa28.62■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Catsper2A2ARP9 588 aa28.62■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Igfbp6P47880 238 aa28.62■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 RestQ8VIG1 1082 aa28.62■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 PigbQ9JJQ0 542 aa28.62■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hspa1lP16627 641 aa28.61■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Htatsf1Q8BGC0 757 aa28.61■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Efcab2Q9CQ46 164 aa28.61■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa28.6■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ddx60E9PZQ1 1711 aa28.6■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tgfb1i1Q62219 461 aa28.59■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ppm1mQ8BU27 406 aa28.59■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Cct4P80315 539 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Cited2-201ENSMUST00000038107 Grm8P47743 908 aa28.57■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Erc2Q6PH08 957 aa28.57■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa28.57■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pard3Q99NH2 1333 aa28.57■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Shank2Q80Z38 1476 aa28.57■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 EngaseQ8BX80 734 aa28.56■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ttll7A4Q9F0 912 aa28.55■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 CalcaP70160 136 aa28.55■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Flad1Q8R123 492 aa28.55■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa28.55■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa28.55■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Smim5Q8BT42 78 aa28.54■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ints5Q8CHT3 1018 aa28.54■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tom1O88746 492 aa28.53■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Slc39a6Q8C145 765 aa28.53■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 AceP09470 1312 aa28.53■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rnf123Q5XPI3 1314 aa28.53■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa28.52■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Prune1Q8BIW1 454 aa28.52■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 DaxxO35613 739 aa28.51■■■□□ 2.16
Cited2-201ENSMUST00000038107 Abcc4E9Q236 1325 aa28.51■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 VgfQ0VGU4 617 aa28.5■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ankle2Q6P1H6 964 aa28.49■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rfx1P48377 963 aa28.48■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 MypnQ5DTJ9 1315 aa28.48■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hspa2P17156 633 aa28.48■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Trim52Q8CDV4 233 aa28.47■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Qtrt2B8ZXI1 415 aa28.46■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Cited2-201ENSMUST00000038107 Unc5clQ6R653 518 aa28.45■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zbtb3Q91X45 518 aa28.45■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Erbb4Q61527 1308 aa28.45■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Pdlim2Q8R1G6 349 aa28.44■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 PappaQ8R4K8 1624 aa28.44■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Antxr1Q9CZ52 562 aa28.44■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Nlrp9bQ66X22 1003 aa28.43■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ddx58Q6Q899 926 aa28.42■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Ripor2Q80U16 1078 aa28.42■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Znf526Q8BI66 675 aa28.42■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Col4a1P02463 1669 aa28.4■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zkscan16A2ALW2 728 aa28.39■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa28.39■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 InsrrQ9WTL4 1300 aa28.39■■■□□ 2.14
Cited2-201ENSMUST00000038107 Rsph3aQ3UFY4 516 aa28.39■■■□□ 2.13
Cited2-201ENSMUST00000038107 Zeb2Q9R0G7 1215 aa28.39■■■□□ 2.13
Cited2-201ENSMUST00000038107 Akap11E9Q777 1895 aa28.38■■■□□ 2.13
Cited2-201ENSMUST00000038107 Crb1Q8VHS2 1405 aa28.38■■■□□ 2.13
Cited2-201ENSMUST00000038107 Syde2E9PUP1 1314 aa28.38■■■□□ 2.13
Cited2-201ENSMUST00000038107 Shank3Q4ACU6 1730 aa28.38■■■□□ 2.13
Cited2-201ENSMUST00000038107 Fam228bQ497Q6 232 aa28.38■■■□□ 2.13
Cited2-201ENSMUST00000038107 NmiO35309 314 aa28.37■■■□□ 2.13
Cited2-201ENSMUST00000038107 Fkbp5Q64378 456 aa28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.8 ms