RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493016.1

TSC22D1-208, Transcript of TSC22 domain family member 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSC22D1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-208ENST00000493016 FOXS1O43638 330 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 ANXA5P08758 320 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 COX6A1P12074 109 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PGAM1P18669 254 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 CXCR2P25025 360 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PTK6Q13882 451 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 FAM53BQ14153 422 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 CRYMQ14894 314 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 C4orf17Q53FE4 359 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PLD3Q8IV08 490 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 CNDP1Q96KN2 507 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 LMF1Q96S06 567 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 DRC3Q9H069 523 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 NOTCH2Q04721 2471 aa15.51■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 A0A1W2PQ72 361 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PCDH17O14917 1159 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 KLHL18O94889 574 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 HEXBP07686 556 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 HRH2P25021 359 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 DR1Q01658 176 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 MFAP5Q13361 173 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TLR1Q15399 786 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 NDUFA9Q16795 377 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 RUNDC3BQ96NL0 473 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 NDNQ99608 321 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 UNC79Q9P2D8 2635 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TTC4O95801 387 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 C8GP07360 202 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PRR35P0CG20 571 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 FDXRP22570 491 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 RGS4P49798 205 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TBPL1P62380 186 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 CDC16Q13042 620 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 SYT16Q17RD7 645 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 SLCO2A1Q92959 643 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 CCDC138Q96M89 665 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PDE10AQ9Y233 779 aa15.49■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 WIPF3A6NGB9 483 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 BANF1O75531 89 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 LDLRP01130 860 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 SERPINA7P05543 415 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 GABRB3P28472 473 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 AVPR1BP47901 424 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 SP140Q13342 867 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 BBS9Q3SYG4 887 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 MSS51Q4VC12 460 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PAQR3Q6TCH7 311 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PALM2Q8IXS6 379 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 GRHL3Q8TE85 626 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PSMF1Q92530 271 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 THAP11Q96EK4 314 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 NAT9Q9BTE0 207 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 PARVBQ9HBI1 364 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 RNF14Q9UBS8 474 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSC22D1-208ENST00000493016 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms